生物分析软件介绍概要1.pptVIP

生物分析软件; GeneDoc;GenDoc界面;功能;DNAman界面; DNAstar;GeneQuest：帮助查找和注释DNA序列中的基因和其他特征序列，包括ORFs，剪接位点，转录因子结合位点，重复序列和酶切位点等。; Clustalx;Phylip;6;序列比对、同源性分析及做生成树分析 如上的软件几乎都能实现以上的目标 DNAman、 Phylip和Mega5比较适合我们 Clustalx更多的是辅助其它软件实现分析;用Clustalx进行序列比对;多序比对步骤：;2编辑序列：可执行如下操作;4完全比对：DO Complete Aligement;Phylip软件构建系统发生树 ;做进化树步骤：;3打开Dnadist.exe ：DNA距离矩阵计算器;5打开Drawtree.exe：无根树; Treeview可以显示Bootstran值 ,序列60条以上时显示较乱，可输出EMF和WMF图片文件看 Phylodraw功能强可调节X、Y轴的值，可输BMP、PS 格式，但不能显示Bootstran值 Njplot可以显示Bootstran值和分值长度。但是不能调节图片X、Y轴的长度 ;其它建树的方法：;Mega5软件构建系统发生树 ;做进化树步骤：;这里选创建新网格;我们这里以DNA序列为例选DNA;这时便可以创建新数据文件;2导入序列：支持fasta、aln等多种格式