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波纹唇鱼微卫星分子标记的筛选及适用性分析.PDF
波纹唇鱼微卫星分子标记的筛选及适用性分析
1 1 2 1 1 1 1
彭艳辉 , 骆 剑 , 尹绍武 , 朱晓平 , 胡 静 , 刘志亮 , 祝 斐 ,
齐兴柱1, 胡亚丽2
(1. , , 570228; 2.
, 210046)
摘要: 采用磁珠富集法及利用生物素标记的(CA)15 寡核苷酸探针从波纹唇鱼(Cheilinus undulatus)基因
组 DNA Bsp143 Ⅰ酶切位点的400~1000 bp 片段中筛选 CA/GT 微卫星位点。洗脱的杂交片段克隆到
PMD18-T 载体上构建富集微卫星基因组文库后, 通过 PCR 筛选出阳性克隆进行测序。在 120 条序列中
有 88 条序列包含有重复次数不少于 5 次的微卫星位点, 阳性序列比例达到73.33% 。其中完美型(perfect)
类型微卫星最多的重复次数为 26 次。在 88 条非冗长序列中, 共有 28 条(31.82%)微卫星重复序列两端
有侧翼序列能够进行引物设计。用波纹唇鱼 3 个个体的混合基因进行引物筛选, 其中的 24 对具有清晰
的扩增条带。将筛选的 24 对引物对波纹唇鱼 1 个群体的 39 个个体进行遗传多样性分析, 其中 4 对引
物扩增产物为单态, 20 对扩增产物呈多态性; 20 对扩增多态的引物在 39 个个体中扩增出等位基因数为
2~12, 平均有效等位基因数为 3.5 。该波纹唇鱼群体的 PIC 、Ho 、He 的平均值分别为 0.0782 、0.8513 、
0.5667 。这 20 个微卫星位点适于波纹唇鱼群体遗传结构的研究分析。
关键词: 波纹唇鱼(Cheilinus undulatus); 微卫星分子标记; 筛选; 磁珠富集法
中图分类号: Q31 文献标识码: A 文章编号: 1000-3096(2012)05-0109-08
(Cheilinus undulatus), ,
(Osteichthyes), (Pereifomes), ,
(Labroidei), (Labridae),
(Cheilinus), [1-2] [18-24]
, ,
,
,
, ,
1 材料与方法
(IUCN)(WWF)
(CITES) 1.1 材料
[3-4] 39
Bsp143I Fermentas ,
[5-15], Promega , T4 DNA pMD18-T
, ,
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