后基因组时代中结构生物学.pdfVIP

# 340 # Pr og. Bioch em . Biophys. 2000; 2 7 (4) 21世纪的生物学 王大成 ( 中国科学院生物物理研究所, 北京 100101) 2000 年6 月26 日, 美英两国首脑会同公私两 组时代中具有战略性的关键地位. 大人基 组测序集团, 在华盛顿白宫东厅正式向世 在后基 组时代中, 生物学的中心任务是揭示 人宣告: 人基 组的工作草图 (working draft) 已 基 组及其所包含的全部基 的功能, 并在此基础 经绘制完成. 以此为标志, 在人类跨进21世纪历 上阐明有机体的遗传、进化、发育、生长、衰老、 史新纪元之际, 生命科学也正在迎来一个崭新的时 死亡等基本生物学问题, 以及与人类健康和疾病相 代, 即后基 组时代 (post2genome era). 这是生 关的生物医学问题. 由于基 的功能最终总是通过 命科学历史发展中一次新的飞跃. 20 世纪生物学 其表达产物蛋白质来实现的, 此要了解基 的全 的最基本成就是揭示生命机体的世代遗传主要是以 部功能活动, 最终也必须回到蛋白质上来. 如果将 基 为载体的核酸负责, 有机体的当代生命活动主 有机体视为一极其复杂的现代化工厂, 基 组是这 要决定于蛋白质的结构与功能, 从而将整个生物学 一工厂的中央控制室, 调控这一工厂正常运转的所 推进到以核酸和蛋白质为中心的分子生物学时代. 有指令都来自这里, 其重要性不言而喻; 但这个工 由此, 生命不再是一个谜. 人基 组的全序测定, 厂的主要工人是以蛋白质为主体的生物大分子, 他 以密码的形式给出了 / 生命之谜0 的谜底. 但是, 们维系着健康机体所需的几乎所有生命活动, 如代 迄今我们仍然读不懂这个谜底. 在以基 组全序为 谢、生长、运动、呼吸、免疫、物质运输、信号传 基础 ( sequence2based) 的后基 组时代中, 将有 导以至遗传信息的表达和调控. 基 组全序测定使 可能从整个基 组及其全套蛋白质产物的结构2功 我们掌握了以密码书写的使工厂运转的全部指令, 能机理的高度去了解生命活动的全貌, 并系统整合 要查明和显示其功能作用显然离不开对执行这些指 有关生物学的全部知识, 揭示生命物质世界的各种 令的工人) ) ) 被编码蛋白质的全面和透彻了解. 前所不知的规律, 完全揭开生命之谜, 进而驾驭生 此, 在人基 组测序之后进一步集中研究蛋白质的 命使之为人类的社会经济生活服务. 这将使生命科 结构与功能, 是揭示基 组功能的基本途径. 离开 学升华到一个新的历史阶段. 站在这双重 / 世纪之 蛋白质, 基 组所蕴涵的信息库将成为无水之源. 交0 的门槛, 展望一下结构生物学在开拓生物学新 现在知道, 以蛋白质为主体的生物大分子的功能主 时期中的地位、影响和发展, 是很有意义的. 但 要决定于它们的三维结构或如近期科学文献中常称 是, 任何中长期的科学预言都是困难的, 实为笔者 的/ 形貌0 (shape) . 此, 在以功能为中心的后 所不能, 此下面谈及的内容大多以已露端倪或已 基 组时代中, 阐释有机体重要生命活动的规律和 经启动的事件为基础, 显示结构生物学跨世纪发展 生命现象的本质, 不仅需要基 组的信息, 还必须 的一些趋势. 依靠全面了解相关蛋白质及其复合物、组装体的精 细三维结构、运动和相互作用, 及其与各种生命活 1 动的功能关系. 事实上, 我们毕竟不能只用基 组 结构生物学是以生命物质的精确空间结构及其 D A 的一 维序 列 去确 定 生命 活动 的机 理 运动为基础来阐明生命活动规律和生命现象本质的 (mechanism) 与功能途径