潮州地区人乳头瘤病毒52型E6多态性分析.pdfVIP

重庆医科大学学报 2012年第 37卷第 3期 (JournalofChongqingMedicalUniversity2012．VO1．37No．3) 一 219 一 DOI：10．39696．issn．0253-3626．2012，03．009 潮州地区人乳头瘤病毒52型E6多态性分析 罗招云，陈 强，杨立业，林 敏 ，李文玉，詹小芬，陈默蕊 (广东省潮州市中心医院检验实验中心，潮州 521021) 【摘 要 】目的：明确潮卅I地区人乳头瘤病毒 Humanpapillomavirus，HPV)52型E6编码区的基因多态性。方法：提取 101例 HPV52单纯感染者宫颈脱落细胞DNA．通过特异性引物扩增HPV52一E6编码区全序列，成功获得 83份HPV52一E6PCR扩增 阳性产物，进行测序及BLAST多态性分析。结果：成功获得76条 HPV52一E6基因全序列(447bp)。该序列与参考株 (GQ472848) 的一致性为99％。在潮州地区发现 11种E6编码区多态性，9种为同义突变 ，2种有义突变，引起所编码氨基酸改变。根据基因多 态性分亚洲群和欧美群2群。亚洲群有7组，第 1组，也是最为常见组(50／76)的编码序列与广州 (EU924143)和香港 (DQ057293) 株编码完全匹配，该组称为潮州地方株 ；第 2组(127／6)多态性与广州(EU924144)等报道的E6全序列完全匹配 ；第 3组(仅 1 例)多态性与浙江大学报道(HM004117)的E6全序列完全匹配；其余4组多态性国际上尚未报道。欧美群有3组，第 1组(5／76) 多态性与美国(HQ537745)报道的E6全序列完全匹配 ；第2组(2例)多态性与美国(DQ057291)和德国(X74481)报道的E6全 序列完全匹配；第 3组(1例)多态性国际上尚未报道。结论：潮州地区HPV52一E6编码区序列存在多态性，以中国东南部和东 南亚国家报道E6编码区序列为主，少数与欧美报道E6全序列完全匹配。为基因疫苗的研制提供了科学依据。 【关键词】人乳头瘤病毒；52型；E6基因；序列分析；多态性 【中国图书分类法分类号】R694．13 【文献标志码 】A 【收稿日期】2011-10—01 AnalysisofE6genepolymorphism oftype52humanpapillomavirusfrOm ChaozhouareaofChina LUOZhaoyun，CHENQiang，YANGLiye，LINMin，LIWenyu，ZHANXiaofen，CHENMorui (CentralLaboratoryofChaozhouCentralHospitalinGuangdongProvince) A【bstract]Objective：TostudythepolymorphismofE6geneofHPV52inChaozhou．Methods：TheDNAwasextractedfromthe cervicalexfoliatedcellsof101casesofsimpleinfectionofHPV 52． 83casesofE6genecompletesequencewasamplifiedsuccess- fullyandsequenced．TheBLAST 2．0softwareonlinewasusedforpolymorphism study．Results：Totally，76completeE6geneswere successfullyamplified．Thesimilaritywas99％comparedwithreferencestrain(GQ472848)．11kindsofpolymorphismwerefound，of which9kindswerenonsensemutationandtheother2kindsweresensemutation，whichwouldcauseaminoacidalteration．Allofthe 76casesweredividedintoAsianclusterandAmeri