2-1生物信息数据库.pdf

第二章生物信息数据库 1、模式生物 2、生物信息数据库 第一节 模式生物 体 原 支 脲 解 菌 杆 螺 门 幽 Ureaplasma Bacillus Drosophila Rickettsia Helicobacter urealyticum subtilis melanogaster prowazekii pylori Buchnera sp. Escherichia human Arabidopsis Thermotoga APS coli maritima Oryza sativa mouse Caenorhabitis rat Borrelia elegans burgorferi Neisseria Plasmodium falciparum Borrelia Aquifex meningitidis Mycobacteriu burgorferi aeolicus Z2491 m tuberculosis 人类基因组，模式生物基因组计划 模式生物基因组计划 人类、酵母、线虫、果蝇、细菌、拟南芥、水稻、斑马 鱼、病毒等共约5000多种已完成，目前有？余种正在进行。 目前总量已达？亿碱基对 （106亿对bp，2009年8月） 已经完成全序列测定的部分物种基因组 中文名称 数目 备 注 古细菌 100 包括热自养甲烷菌、热球菌等 真细菌 1440 其中5个细菌各测定了多个菌株 真核生物 134 酵母、线虫、果蝇、人、拟南芥、水稻、 玉米、苜蓿、大豆 细胞器 1490 各种叶绿体、线粒体、质体等 古细菌病毒 42 噬菌体 649 包括不同亚类或不同菌株 类病毒 53 包括不同亚类或不同菌株 病毒 2393 包括不同亚类或不同菌株 引自http://www.ebi.ac.uk/genomes/ (Mar, 2011) Completed Genome Web page of EBI-EMBL(The European Bioinformaticas Institute, European Molecular Biology Laboratory) Predicated human genes count Genome