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基于ITS和ndhF-rpl32
生物多样性 2016, 24 (3): 296–303 doi: 10.17520/biods.2015259
Biodiversity Science http: //
·研究报告·
基于ITS和ndhF-rpl32序列的
荞麦种间亲缘关系分析
1, 2 2, 3* 2 2 1*
胡亚妮 张宗文 吴 斌 高 佳 李艳琴
1 (山西大学生物技术研究所, 太原 030006)
2 ( 中国农业科学院作物科学研究所, 北京 100081)
3 ( 国际生物多样性中心中国办事处, 北京 100081)
摘要: 荞麦起源于我国, 演化形成了丰富的物种和遗传多样性。为了有效研究和利用荞麦及其野生种资源, 以从
四川、甘肃、贵州等地采集的荞麦属(Fagopyrum)10个种(含变种、亚种和复合体种)共71份材料为对象, 通过ITS
和叶绿体ndhF-rpl32序列分析, 利用MEGA5.0构建系统进化树, 探讨了荞麦种内及种间亲缘关系。结果表明, 在
ITS序列矩阵中, 序列长度为725 bp, 信息位点为150个, 占序列总长度的20.7%; 在ndhF-rpl32序列矩阵中, 序列长
度为940 bp, 信息位点为158个, 占序列总长度的16.8%。由ITS序列和ndhF-rpl32序列构建的两个进化树都可以将
71份材料分为大粒荞麦种组和小粒荞麦种组; 其中, 大粒荞麦种组包括栽培苦荞和米苦荞(F. tataricum) 、金荞复合
体(F. cymosum complex)、栽培甜荞(F. esculentum)和野生甜荞(F. esculentum ssp. ancestralis); 小粒荞麦种组包括齿
翅野荞(F. gracilipes var. odontopterum) 、疏穗小野荞(F. leptopodum var. grossii) 、小野荞(F. leptopodum) 、密毛野荞(F.
densovillosum)、细柄野荞(F. gracilipes)和硬枝万年荞(F. urophyllum) 。而ndhF-rpl32序列构建的系统发育树还能区分栽
培甜荞和野生甜荞, 具有更好的聚类效果。另外, 与栽培甜荞相比, 金荞复合体与栽培苦荞的亲缘关系更近。该研
究为荞麦属种的分类和条形码研究提供了一定的科学依据。
关键词: Fagopyrum ; 亲缘关系; ITS; ndhF-rpl32
Genetic relationships of buckwheat species based on the sequence analy-
sis of ITS and ndhF-rpl32
1, 2 2, 3* 2 2 1*
Yani Hu , Zongwen Zhang ,
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