希金斯炭疽菌磷脂酰肌醇特异性磷脂酶c 生物信息学分析.pdf

江苏农业科学　２０１６年第４４卷第１０期 — １７７— 韩长志．希金斯炭疽菌磷脂酰肌醇特异性磷脂酶Ｃ生物信息学分析［Ｊ］．江苏农业科学，２０１６，４４（１０）：１７７－１８０． ｄｏｉ：１０．１５８８９／ｊ．ｉｓｓｎ．１００２－１３０２．２０１６．１０．０４６ 希金斯炭疽菌磷脂酰肌醇特异性磷脂酶 Ｃ 生物信息学分析 韩长志 （西南林业大学林学院云南省森林灾害预警与控制重点实验室，云南昆明６５０２２４） 　　摘要：希金斯炭疽菌侵染菜心、萝 卜等十字花科植物引起炭疽病，给各国农业生产造成了巨大的经济损失。基于 酿酒酵母典型的磷酸肌醇特异性磷脂酶Ｃ（ＰＩ－ＰＬＣ）序列，利用Ｂｌａｓｔｐ以及关键词对该菌蛋白质数据库进行比对、搜 索，以及通过ＳＭＡＲＴ分析，明确该菌存在８个典型的ＰＩ－ＰＬＣ序列；通过生物信息学分析，明确上述ＰＩ－ＰＬＣ序列在 蛋白质二级结构组成、信号肽等方面均具有一定差异。遗传关系比较分析明确该菌中的ＰＩ－ＰＬＣ序列与禾谷炭疽菌 （Ｃｏｌｌｅｔｏｒｉｃｈｕｍｇｒａｍｉｎｉｃｏｌａ）、松针炭疽菌（Ｃ．ｆｉｏｒｉｎｉａｅ）等炭疽菌属中的病菌具有较近的亲缘关系。 　　关键词：希金斯炭疽菌；磷脂酰肌醇特异性磷脂酶Ｃ；亚细胞定位；二级结构；炭疽菌属 　　中图分类号：Ｓ４３２．４　　文献标志码：Ａ　　文章编号：１００２－１３０２（２０１６）１０－０１７７－０４ 　　植物与病原菌互作过程中，众多细胞信号转导途径参与 组序列的释放［１６］，林春花等对其开展了ＭＡＰＫ途径相关基因 ［１７］ 其中，现已明确Ｇ蛋白信号途径及其下游的ＭＡＰＫ信号传导 的找寻及信号通路简图的绘制工作 ，韩长志对其进行了 ［１８］ ［１９］ ［２０］ 途径和ｃＡＭＰ信号传导途径具有重要的作用。因此，学术界 ＲＧＳ 、１４－３－３ 、ｓｅｐｔｉｎ 、ＡＣ、ＰＩＴＰ等蛋白生物信息学 ［１］ 关于真菌ＲＧＳ的研究产生了较多成果 ，磷酸肌醇特异性磷 分析。此外，对于该菌致病基因的研究，建立根癌农杆菌介导 脂酶Ｃ（ＰＩ－ＰＬＣ）的一种异构体ＰＩ－ＰＬＣ 为磷脂肌醇信号 的转化技术及直接重复重组介导的基因打靶等技术［９－１０］。 β ［２］ 途径ＰＫＣ系统中的重要效应物 ，可以将４，５－二磷酸磷脂 华中农业大学黄俊斌教授实验室建立了希金斯炭疽菌转化子 酰肌醇水解为三磷酸肌醇和二酰甘油，而上述分子均作为细 的突变体库，为进一步对这些转化子基因功能研究提供了技 胞信号转导的第二信使，发挥着重要作用。 术支持［２１－２２］。然而，对于该菌中存在的ＰＩ－ＰＬＣ数量、功能 希金斯炭疽菌（ＣｏｌｌｅｔｏｔｒｉｃｈｕｍｈｉｇｇｉｎｓａｎｕｍＳａｃｃ．）可以侵 尚不清楚。本研究利用酿酒酵母 Ｓ２８８ｃ（Ｓａｃｃｈａｒｏｍｙｃｅｓｃｅｒｅｖｉ 染菜心、萝 卜等十字花科蔬菜引起炭疽病，该菌现主要分布于 ｓｉａｅＳ２８８ｃ）中已经报道的ＰＩ－ＰＬＣ氨基酸序列，通过在炭疽 ［３－５］ ［２３］ 美国、日本、印度等国家 ，在我国，由该菌侵染菜心引起的 菌属蛋白质数