圆二色谱测定技术在小分子化合物与dna 相互作用研究中 - 药学学报.pdf

1478 药学学报 Acta Pharmaceutica Sinica 2010, 45 ( 12) : 1478 1484 圆二色谱测定技术在小分子化合物与DNA 相互作用研究中的应用 刘振佳, 司伊康, 陈晓光* ( 中国医学科学院、北京协和医学院药物研究所, 北京 100050) 摘要: 圆二色谱 (CD) 是研究DNA 构象随环境条件 (如温度、离子强度和pH) 的改变而变化的检测技术, 也是研究DNA 与配基 (包括小分子和蛋白质等大分子) 相互作用的有力工具。DNA 的圆二色谱是由其骨架结构 中的不对称糖分子和由这些糖分子的构型决定的螺旋结构产生的。根据配基对原有的DNA 圆二色谱信号的影响, 以及诱导产生的圆二色谱 信号 (ICD) 的不同特点, 不仅可以得知配基与 DNA 具有相互作用, 还可以推断配 基与DNA 结合的不同模式。研究表明这些ICD 信号是由配基的电子跃迁偶极矩与DNA 的碱基电子跃迁偶极矩 在DNA 不对称环境中发生偶合产生的。如果使用不同序列的短链DNA 进行深入的研究, 还可获知配基与DNA 相互作用中的序列特异性。实验已经证明, 圆二色谱法虽然灵敏度较低, 但它具有快速、简便、样品用量少、对 构象变化敏感及不受分子大小的限制等特点, 可以作为核磁共振 (NMR) 和 X-光单晶衍射技术的补充。本文将 介绍圆二色谱技术在研究 DNA 与小分子化合物相互作用中的应用以及本实验室利用圆二色谱技术研究抗肿瘤 药的初步结果。由于圆二色谱可作为 药研究中发现先导化合物辅助筛选的手段, 因此可用于发现更多以 DNA 为靶点的药物, 如抗肿瘤药、抗菌药、抗病毒药等。 关键词: 圆二色谱; 诱导圆二色谱; 抗肿瘤药; 药物与DNA 相互作用; DNA 嵌入; DNA 沟结合 中图分类号: R917 文献标识码:A 文章编号: 05 13-4870 (2010) 12-1478-07 Application of circular dichroism to the study of interactions between small molecular compounds and DNA * LIU Zhen-j ia, SI Yi-kang, CHEN Xiao-guang (Institute of Materia Medica, Chinese Academy of M edical Sciences Peking Union M edical College, Beij ing 100050, China) Abstract: Circular dichroism (CD) is an useful technique for monitoring DNA conformation changes resulting from changes in environmental conditions, such as temperature, ionic strength, and pH, and also for the study of the interaction between DNA and ligands (including small