一株鸽源新城疫病毒HN基因分析Analysis of HN gene from a - abc.PDF

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一株鸽源新城疫病毒HN基因分析 Analysis of HN gene from a novel pigeon NDV 汇报人:王 琪 小组成员:李连峰,张晓战,董书伟 2013.12.1 项目背景 • 新城疫(newcastle disease,ND)是由新城疫病毒 (NDV)引起禽的严重的呼吸道疫病,OIE将其列 为A类疫病,危害严重。 研究背景 新城疫(Newcastle disease, ND) 急性 高度接触性 宿主谱广 研究背景 新城疫病毒(Newcastle disease virus, NDV) 3’ NP P M F HN L 5’ Leader 6nt 12nt 6nt Trailer ……Gene Star……Gene End.….Intergenic (1-47 nt)……Gene Star……Gene End….. 单股负链不分节段RNA病毒  副粘病毒科,禽腮腺炎病毒属 基因组全长15186/15192/15198 nt  F为毒力主要决定基因  M: 病毒形态形成  F/HN 研究背景 F/HN 囊膜蛋白 Yuan, P., et al. Structure, 2005 F HN  膜融合  受体结合  介导病毒进入细胞  NA活性  毒力因子、保护性抗原  保护性抗原 项目背景 • F基因是NDV的主要毒力决定基因,以前的 研究表明:强弱毒F蛋白裂解位点氨基酸序 列各不相同, • 强毒株序列为:112R/K-R-Q-K/R-R-F117 (在Q两侧各有一对碱性氨基酸) • 弱毒株序列为:112G/E-K/R-Q-G/E-R- L117 (以中性氨基酸取代了强毒株中的碱 性氨基酸) 科学问题 • 最近分离的一株鸽源NDV,其F基因虽然具有强毒序列特征, 但其毒力较低,且通过反向遗传手段,用标准强毒的F基 因替换后,其毒力仍然较低(Dortmans J. C,etal)。 • 科学问题:鸽源NDV毒力是否与另外一中囊膜蛋白--血 凝 素 神 经 氨 酸 酶(HN) 有关??? 测序及序列分析 设计针对保守区域的引物,扩增出HN CDS,分 别与强毒株和弱毒株相应序列进行比对。 弱毒(LaSota)

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