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一株鸽源新城疫病毒HN基因分析Analysis of HN gene from a - abc
一株鸽源新城疫病毒HN基因分析
Analysis of HN gene from a novel
pigeon NDV
汇报人:王 琪
小组成员:李连峰,张晓战,董书伟
2013.12.1
项目背景
• 新城疫(newcastle disease,ND)是由新城疫病毒
(NDV)引起禽的严重的呼吸道疫病,OIE将其列
为A类疫病,危害严重。
研究背景
新城疫(Newcastle disease, ND)
急性
高度接触性
宿主谱广
研究背景
新城疫病毒(Newcastle disease virus, NDV)
3’ NP P M F HN L 5’
Leader 6nt 12nt 6nt Trailer
……Gene Star……Gene End.….Intergenic (1-47 nt)……Gene Star……Gene End…..
单股负链不分节段RNA病毒
副粘病毒科,禽腮腺炎病毒属
基因组全长15186/15192/15198 nt
F为毒力主要决定基因
M: 病毒形态形成
F/HN
研究背景
F/HN 囊膜蛋白
Yuan, P., et al. Structure, 2005
F HN
膜融合 受体结合
介导病毒进入细胞 NA活性
毒力因子、保护性抗原 保护性抗原
项目背景
• F基因是NDV的主要毒力决定基因,以前的
研究表明:强弱毒F蛋白裂解位点氨基酸序
列各不相同,
• 强毒株序列为:112R/K-R-Q-K/R-R-F117
(在Q两侧各有一对碱性氨基酸)
• 弱毒株序列为:112G/E-K/R-Q-G/E-R-
L117 (以中性氨基酸取代了强毒株中的碱
性氨基酸)
科学问题
• 最近分离的一株鸽源NDV,其F基因虽然具有强毒序列特征,
但其毒力较低,且通过反向遗传手段,用标准强毒的F基
因替换后,其毒力仍然较低(Dortmans J. C,etal)。
• 科学问题:鸽源NDV毒力是否与另外一中囊膜蛋白--血 凝
素 神 经 氨 酸 酶(HN) 有关???
测序及序列分析
设计针对保守区域的引物,扩增出HN CDS,分
别与强毒株和弱毒株相应序列进行比对。
弱毒(LaSota)
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