ITS序列分析相关的名词解释.docVIP

1 DNA分子标记：在DNA分子上检测生物间的差异，是DNA水平遗传变异的直接 反映。DNA分子标记能对各个发育时期的个体、各个器官甚至细胞作检测，不受环境与基因表达与否的限制，数量极多，遍及整个基因组，多态性高，遗传稳定 DNA条形码-新的生物身份识别系统（以染色体组为基础）：利用标准的、有足够变异的、易扩增且相对较短的DNA片段对物种进行快速、准确地自动鉴定。与传统鉴定方法的理论基础不同，DNA条形码技术基于物种基因型的差异，而不是环境密切相关的表现型，克服了传统鉴定方法的诸多缺陷，具有鉴定结果准确、可重复性良好、方法通用性强等优点。还有助于发现新种和隐种。 DNA条形码的优点：1 以信息稳定的DNA序列为检测对象，每一物种具有各自特定的DNA序列信息，同种生物不同生长期具有相同的DNA序列信息，即使经过加工使其形态发生变化，但其DNA序列信息不会改变，而传统形态学鉴定特征会因趋同性和变异导致鉴定错误；与传统分类方法相比，DNA条形码技术矿大了检测样本的范围，即使样本部分受损也不会影响鉴定结果。2 能够抛开形态相似的假象，从基因水平上对传统分类方法难以区分的类群进行物种鉴定。3 建立DNA条形码数据库，不但可以一次性鉴定大量物种，而且可以提供各物种的明确信息；不仅能够弥补传统分类学对物种形态描述的不足，而且还可以加快对已知物种的识别速度；同事有助于发现新物种。4 在DNA条形码技术的基础上研制简便和高效的条形码扫描仪，可以加快物种鉴定和进化研究的步伐，有益于推进分类学研究基础薄弱的国家，尤其是发展中国家物种鉴定及进化研究的步伐。 传统鉴定（中药材四大传统鉴定方法：基原鉴定、性状鉴定、显微鉴定和理化鉴定）的缺点：基原鉴定和性状鉴定难以区分形态性状相似的近缘种，且药用植物形态性状易受地理生态环境、生长期等因素影响，从而影响鉴定结果的准确性；理化鉴定中的活性成分易受其生理条件、采收时间的因素的影响，同时对化学成分相似的物种也较难区分。 2 ITS序列：在 rDNA 基因中，16S rDNA 和 28S rDNA 基因间隔序列称为（ITS）。非编码区 用途：在种间及种下居群间具有进化速率快，变异程度高、区分物种能力强的特点，适用于药用植物与其近缘种类等较低分类阶元的分子鉴定。 6 非转录间隔区：DNA分子中，不同基因（操纵子）之间的非转录序列 7 保守序列：指DNA分子中的一个核苷酸片段或者蛋白质中的氨基酸片段，它们在进化过程中基本保持不变。 10 信息位点：信息位点就是指能由位点产生的突变数目把一棵树与其它树区分开来的位点。信息位点是指那些至少存在2个不同核苷酸且每个不同核苷酸至少出现两次的位点。 11 系统学:是提炼系统论、信息论、控制论的共同基础理论而形成的一门学科，建立系统科学基础科学的这种系统学是由中国学者钱学森所倡导 12 指纹图谱：中药指纹图谱是指某些中药材或中药制剂经适当处理后，采用一定的分析手段，得到的能够标示其化学特征的色谱图或光谱图。 13 遗传多样性：遗传多样性又称为基因多样性。是生物多样性的重要组成部分。同种个体间因为其生活环境的不同，经历长时间的天择、突变所产生的结果。如果遗传多样性越高，则族群中可提供环境天择的基因愈多；相对的，对于环境适应能力就愈强，有利于族群的生存及演化。 14 RAPD技术：随机扩增多态性DNA，是一种基于PCR的分子标记。利用随机引物对基因组DNA进行扩增，由于引物在DNA模板上的结合位点不同，所以就可以扩增出不同长度的多态性片段，是基于全基因组水平上检测DNA变异的一种快速、有效的技术体系。 15 亲缘关系：生物类群在系统发生上所显示的某种血缘关系 17 系统发育树：进化树的构建是一个统计学问题，我们所构建出来的进化树只是对真实的进化关系的评估或者模拟。进化树由结点和进化分支组成，每一结点表示一个分类学单元（属、种群、个体等），进化分支定义了分类单元（祖先与后代）之间的关系，一个分支只能连接相邻的节点。进化树分支的图像称为进化的拓扑结构，其中分支长度表示该分支进化过程中变化的程度，标有分支长度的进化分支叫标度枝。校正后的标度树常常用年代表示，这样的树通常根据某一或部分基因的理论分析而得出。进化分支可以没有分支长度的标注，没有被标注的分支长度不表示变化的程度，随让分支的有些地方用数点进行了注释。无根的树只是指明了种属的相互关系，没有确认共同祖先或进化途径。 目的：建树的目的是为了检验每个物种的单系性，即同一个物种的不同个体能否紧密聚集在一起 18 genbank:是由NCBI编护的DNA和RNA序列数据库 为了分析核酸和蛋白质序列中所含有的生物信息，众多研究机构开发了专业性的 19 FAS格式：FASTA格式-由于genbank与EMBL数据格式比较复杂