环糊精在金属酶模拟中的应用 - 中国科学.pdf

中国科学 B 辑 :化学 2009 年 第 39 卷 第 4 期 : 289 ~ 300 SCIENCE IN CHINA PRESS 环糊精在金属酶模拟中的应用 周映华, 毛宗万* 中山大学化学与化学工程学院, 生物无机与合成化学教育部重点实验室, 广州 510275 * 通讯作者, E-mail: cesmzw@ 收稿日期：2008-12-02; 接受日期：2008-12-27 摘要 非共价作用(如氢键、静电和疏水作用)普遍存在于天然金属酶中, 对酶活化 关键词 或底物催化过程有重要的协同作用. 近年来基于超分子化学理论的金属酶模拟研究 金属酶模拟 不断向酶的活性中心亚稳态和次层结构的生物功能模拟方向发展. 本文将根据报道 环糊精 的文献并结合本课题组的研究工作, 对环糊精(一种重要的超分子主体)构建金属酶 包合物 超分子化学 模型的研究进行综述. 天然酶(enzyme) 是生物体内细胞产生的一种生 金属酶的催化中心及其亚稳态、次层结构的疏水环境 物催化剂, 能在机体中十分温和的条件下, 高效率地 及底物识别基团的模拟[8], 在超分子层次上实现金属 催化各种生物化学反应, 促进生物体的新陈代谢. 大 酶结构和功能的模拟, 如图 1 所示. 超分子金属酶模 多数酶分子中含有多肽链组成的蛋白质( 酶蛋白, 型一般是通过具有催化功能的金属配合物与主体分 apoenzyme), 还有非蛋白成分(辅助因子, cofactor, 如 子(如蛋白质、DNA 、抗体、环糊精和杯芳烃等)进行 金 属 离 子 或 铁 卟 啉 等 ), 两 者 一 起 组 成 全 酶 有机/无机杂化得到的催化剂, 可以提供特定的第二 (holoenzyme)[1,2]. 大约有三分之一的酶在它们本身结 配位环境(the second coordination sphere)构建反应的 [9] 构中含有金属离子或者本身虽不含金属但必须有金 预组织结构而诱导反应的区域/立体选择性 . 属离子存在才具有活力, 前者称为金属酶, 后者称为 金属激活酶. 在金属酶中, 金属和酶蛋白牢固地结合 在一起, 金属离子通常为活性中心[3,4]. 酶的蛋白质 工程及模拟研究表明金属酶的活性不仅由其活性中 心的金属离子决定, 金属离子附近的氨基酸残基通 过识别底物参与催化过程而对金属酶的催化活性也 [5,6] 有重要影响 . 早期金属酶模拟研究是以天然酶中的金属中心 及其配位基团为对象, 设计和合成对应的金属配合 物, 试图通过对金属酶活性中心结构的简单模拟来 揭示金属酶的结构与功能的关系[7]. 近年来, 超分子 研究方法与技术的引入, 使得金属酶的模拟从酶催 化中心的金属离子及其配位基团的模拟, 发展到对 图 1 金属酶的第一和第二配位环境示意图 289 周映华等: 环糊精在金属酶模拟中的应用 环糊精(cyclodextrin, CD) 是环糊精糖基转移酶 四种方式, 功能基桥联环糊精的一个疏水空腔与具 (CGTase)作用于淀粉或直链糊精所产生的一类环状 有催化功能的金属配合物超分子组装, 另一个疏水 低聚糖的总称, 由多个D -吡喃型葡萄糖通过α-1,4 糖 腔在催化过程中识别底物分子, 使分子间的催化