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结核分枝杆菌比较基因组学研究进展
科技通报科技通报
第29卷第9期 Vol.29 No.9
2013年9月 BULLETINOFSCIENCEANDTECHNOLOGY Sep. 2013
结核分枝杆菌比较基因组学研究进展
1,2 1,2* 2,3*
池水晶 ,宝福凯 ,柳爱华
(1.昆明医科大学病原生物学与免疫学系,昆明650031;2.昆明医科大学热带医学研究所,昆明650031;
3.昆明医科大学生物化学与分子生物学系,昆明650031)
摘 要:H37Rv全基因组测序的完成,使得结核分枝杆菌遗传背景不清的状况得到改善。随后,结核分
支杆菌等大量模式生物基因组完成测序,产生了丰富的生物信息资源,而随之发展起来的BLAST 、
FASTA和CLUSTALW等生物信息技术为比较基因组学研究提供强有力的支撑。通过结核比较基因组
学研究为结核分支杆菌的进化和分类,找寻结核毒力因子,及筛选抗结核药物靶标提供良好的契机。
关键词:结核分枝杆菌;基因组;比较基因组学;进化;分类;毒力因子;药物靶标
中图分类号:R378.91 文献标识码:A 文章编号:1001-7119(2013)09-0040-06
RecentProgressonComparativeGenomicsofMycobacteriumtuberculosis
1,2 1,2* 2,3*
ChiShuijing ,BaoFukai ,LiuAihua
(1.DepartmentofPathogenBiologyandImmunology,KunmingMedicalUniversity,Kunming650031,China;
2.TheInstituteforTropicalMedicineKunmingMedicalUniversity,Kunming650031,China;
3.DepartmentofBiochemistryandMolecularBiology,KunmingMedicalUniversity,Kunming650031,China)
Abstract:ThewholegenomesequencingofH37Rvhasbeencompleted,sothat theuncleargenetic
backgroundoftheMycobacteriumtuberculosishasbeenimproved.Subsequently,awealthofbiological
information resources generated,because of a large number of model organisms genome of
Mycobacterium tuberculosis sequencing completed, as BLAST, FASTA and CLUSTAL W et.al.
developed , Bio IT provides a strong support for comparative genomics research. Mycobacterium
tuberculosis comparative genomics research provide a good chance to find the Evolution and
classificationofMycobacteriumtuberculosis,tuberculosisvirulencefactors,andanti-TBdrugtarget
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