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prrsv-gp5 基因的克隆及其b 细胞抗原表位预测 - 四川农业大学学报.pdf

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prrsv-gp5 基因的克隆及其b 细胞抗原表位预测 - 四川农业大学学报

第34 卷 第2 期 四川农业大学学报 Vol.34 No.2 2016 年6 月 Journal of Sichuan Agricultural University Jun. 2016 doi :10. 16036/j. issn. 1000-2650. 2016. 02. 019 PRRSV-GP5 基因的克隆及其B 细胞抗原 表位预测与分析 1,2 1* 尹国友 ,王林嵩 (1. 河南师范大学生命科学学院,河南新乡 453007;2. 河南城建学院生命科学与工程学院,河南平顶山 467036) 摘要:【目的】研究PRRSV-GP5 基因B 细胞抗原表位性质。【方法】根据GenBank 上发表猪繁殖与呼吸综合征病毒 (PRRSV)ATCC VR-2332 的全基因序列,设计并合成引物,采用RT-PCR 技术,对阳性病料扩增回收,并将其克隆入 pMD18-T 载体中,送上海生工测序。应用生物信息学同源模型化的方法建立其PRRSV-GP5 蛋白3D 结构,并根据 生物信息学软件DNAStar 预测PRRSV-GP5 蛋白的二级结构、表面可及性、抗原指数、亲水性及柔韧性,综合分析预 测其B 细胞抗原表位。【结果】结果表明,其肽段30-36、50-55、140-142、146-151 和196-198 可能是其优势B 细胞 抗原表位区域。【结论】该基因高度保守,PRRSV-GP5 蛋白呈现较规则的空间结构,同时该结果将为PRRSV-GP5 蛋 白体外表达产物的应用和基因工程疫苗的研究提供理论依据。 关键词: PRRSV-GP5 ;克隆;抗原表位 中图分类号: 文献标志码: 文章编号: Q518.2 A 1000-2650(2016)02-0234-05 PRRSV-GP5 Gene Cloning and Analysis of B Cell Antigen Epitope YIN Guo-you1,2 ,WANG Lin-song1* (1. Department of Bioscience ,Henan Normal University ,Xinxiang 453002 ,Henan ,China; 2. School of Life Science and Engineer,Henan University of Urban Construction ,Pingdingshan 467036,Henan,China ) Abstract: 【Objective 】The objective of this experiment was to study the B cell epitopes of PRRSV-GP5 gene. 【Method 】Primers for RT-PCR amplification of PRRSV isolates from Heilongjiang were designed according to the sequence of ATCC VR-2332 strain porcine reproductive and respiratory syndrome virus published in the GenBank,and sequences were cloned into pMD18-T vector respectively and sequenced in Shanghai. The 3D model of PRRSV-GP5 protein was obtained

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