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病毒与其寄主互作的研究取得了很大的进展
马铃薯Y病毒属病毒基因功能研究进展
李向东1* 于晓庆1 古勤生2 刘金亮1 竺晓平1 郭兴启3
(1 山东农业大学植保学院植物病理系,山东泰安 271018;2 中国农科院郑州果树所,河南郑州,450009;3 山东农业大学生命科学院,山东泰安 271018)
摘要:马铃薯Y病毒属是植物病毒中最大的属。近年来马铃薯Y病毒属功能基因组学取得了很大进展。本文综述了在病毒系统侵染、蚜虫和种子传毒、症状形成等方面的研究结果。
关键词:马铃薯Y病毒属,蚜虫传毒,种子传毒,症状形成
中图分类号:Q78 S532 文献标识码: A
Advances on functional genomics of potyviruses
LI Xiangdong1, YU Xiaoqing1, GU Qinsheng2, LIU Jinliang1, ZHU Xiaoping1, GUO Xingqi3
(1 College of Plant Protection, Shandong Agricultural University, Taian 271018, China; 2 Institute of , CAAS, Zhengzhou 450009, China; 3 College of Life Sciences, Shandong Agricultural University, Taian 271018, China)
Abstract:Potyvirus is the largest genus in plant virus. Great progress has been made on the researches on functional genomics of potyviruses in recent years. Advances on mechanisms of systemic infection, virus transmission by aphids and seed, symptom expression were reviewed in this paper.
Keywords:Potyvirus,virus transmission, symptom expression
马铃薯Y病毒属(Potyvirus)是植物病毒中最大的属,有大约200种确定和可能的种,能侵染茄科、藜科、豆科、葫芦科等多种植物,并造成重大经济损失。该属病毒的颗粒弯曲线状,无包膜,长约680~900 nm,直径约11~15 nm 。基因组为正义单链RNA,长约10kb,5?-末端共价结合基因组连接蛋白(viral protein, genome-linked,VPg),3?-末端为多聚腺苷酸尾。它只包含一个开放阅读框架(ORF),进行表达时先翻译成一个大的多聚蛋白,再通过自身编码的蛋白酶将多聚蛋白加工成有功能的蛋白。
近10年来马铃薯Y病毒属功能基因组学取得了重要进展,对病毒基因功能及与其互作的寄主蛋白都取得了很大进展,尤其是对蚜传、种传、症状形成等问题有了更深入的认识。
1 研究方法
侵染性克隆(infectious cDNA clone, icDNA)的构建和突变技术的应用促进了病毒基因功能的研究。目前已经构建了一些马铃薯Y病毒属病毒的icDNA,如马铃薯Y病毒(Potato virus Y,PVY)、马铃薯A病毒(Potato virus A,PVA)、烟草蚀纹病毒(Tobacco etch virus, TEV)、李痘病毒(Plum pox virus,PPV)、小西葫芦黄花叶病毒(Zucchini yellow mosaic virus, ZYMV)、芜菁花叶病毒(Turnip mosaic virus,TuMV)和烟草脉斑驳病毒(Tobacco vein motting virus, TVMV)等。这些icDNA,有的是携带T7启动子,需要在体外转录出RNA,RNA具有侵染性可以用于接种植物;有的是在CaMV 35S启动子下游,可以直接用质粒DNA接种,在体内转录产生有侵染性的病毒RNA。如果能将报告基因(如编码GUS的uidA和编码绿色荧光蛋白的gfp等)克隆到icDNA中,使其与病毒蛋白形成融合蛋白,或使其经过酶切后释放出游离的报告蛋白,可以更方便地研究病毒基因的功能和调控表达。
有了病毒的icDNA,我们就可以根据生物学性状不同的病毒分离物的序列差异,或者针对高度保守的结构域可以构建一系列突变体,通过突变体的表现型来研究病毒基因的功能。突变体的构建策略主要有:
1 利用icDNA上的酶切位点可以构建缺失突变体。不足之处是可用的酶切位点少,而且利用这个方法不能明确是哪个氨基酸在起作用。
2 定点突变。最常用的方法是将突变
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