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细菌的分类和鉴定
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一、微生物的分类
根据微生物的大小、结构、组成等分三类
原核细胞型
如:细菌、放线菌、螺旋体、支原体、衣原体、立克次体。(也称广义的细菌)
真核细胞型
如:真菌、原虫
非细胞型
如:病毒、亚病毒、朊粒
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二、细菌的分类方法
根据每种细菌各自特征,并按照它们的亲缘关系分类,分类方法有两类
1.生理学与生化学分类法(传统方法)
2.遗传学分类法
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(一)生理学与生化学分类法
主要以细菌的形态、染色以及细菌的特殊结构为最基本的分类依据,其它依据还包括细菌生长条件等等。
主要有两种方法
1、传统分类法
2、数值分类法
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1、传统分类法
主要以细菌的形态、生理特征为分类基础,选择一些较稳定的生物学性状如细菌的形态结构、染色性、培养特性、生化反应、抗原性等作为依据,然后按主次顺序逐级区分。
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2、数值分类法
对细菌各种生物学性状按“等重要原则”进行分类,选用多项生理、生化指标逐一进行比较,通过查表或计算机分析各菌间相似度,完成细菌分类。
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(二)遗传学分类法
以细菌的核酸、蛋白质等在组成的同源性程度分类。
主要有三种方法
1、DNA G+C mol%测定
2、核酸同源值测定
3、核蛋白体RNA碱基序列测定
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1、DNA G+C mol%测定
DNA分子两条链上4种碱基的总分子量为100,测定其中G+C或A+T摩尔百分比,能反应出细菌间DNA分子的同源程度,习惯上以G+C 作为细菌的分类标记。
不同菌属间的G+C mol%范围很大,在25%~75%之间,但同一种细菌G+C mol%相当稳定,不受菌龄、培养条件和其它外界因素影响,亲缘关系越近的细菌,它们G+C mol%越接近(但并非G+C mol%越接近,亲缘关系就越近???)。
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2、核酸同源值测定
为什么不能说G+C mol%越接近,亲缘关系就越近?
因为G+C mol%只能反映细菌的碱基总数而不能反映碱基序列!!!
而利用DNA分子杂交的技术就可以精确测定DNA分子的碱基序列。这就是核酸同源值测定。
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3、核蛋白体RNA碱基序列测定
核蛋白体RNA碱基序列测定属于核酸范畴。
由于核蛋白体RNA(rRNA)序列比较保守,其变化十分缓慢。其中,16s rRNA具有高度的保守性和特异性以及该基因序列足够长,因此,被作为细菌鉴定的快速、准确方法,素有“细菌化石之称”。
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(三)两类分类法的优点和意义
方 法
优 点
意 义
生理学与生化学分类法
方便、简单、廉价
主要用于鉴定
遗传学分类法
准确、可靠;
有利于了解细菌的进化和原始亲缘关系
主要用于分类
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三、原核微生物(广义细菌)分类系统
《伯杰鉴定细菌手册》
(Bergey’s Manual of Determinative Bacteriology)
伯杰氏手册:是目前进行细菌分类、鉴定的最重要参考书,其特点是描述非常详细,包括对细菌各个属种的特征及进行鉴定所需做的实验的具体方法。
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四、细菌的分类等级
界 (Kingdom)
门 (Phylum)
纲(Class)
目(Order)
科(Family)
属(Genus)
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