代谢组学研究的实验方法.PDFVIP

代谢组学研究的实验方法 刘博 代谢组学产生背景 1 代谢组学定义及特点 2 代谢组学研究方法 3 代谢组学应用及前景 4 代谢组学是继基因组学和蛋白质组学之后新近发展起来的 一门学科。基因组学和蛋白质组学分别从基因和蛋白质层 面探寻生命的活动，而实际上细胞内许多生命活动是发生 在代谢物层面的，如细胞信号释放（cell signaling ）， 能量传递，细胞间通信等都是受代谢物调控的。代谢组学 正是研究代谢组（metabolome ）——在某一时刻细胞 内所有代谢物的集合——的一门学科。 “基因组学和蛋白质组学告诉你什么可能会发生，而代谢 组学则告诉你什么确实发生了。” 代谢组学普适性 代谢组学定义 代谢组学（metabonomics）是指通过 组群指标分析，进行高通量检测和数据 处理，研究生物体整体或组织细胞系统 的动态代谢变化，特别是对内源代谢、 遗传变异、环境变化乃至各种物质进入 代谢系统的特征和影响的学科 代谢组学的概述 •代谢组学是效仿基因组学和蛋白质组学的研究思想，对生物体内 所有代谢物进行定量分析，并寻找代谢物与生理病理变化的相对关 系的研究方式，是系统生物学的组成部分。 •其研究对象大都是相对分子质量1000以内的小分子物质。 •先进分析检测技术结合模式识别和专家系统等计算分析方法是代 谢组学研究的基本方法。 •其样品主要是动植物的细胞和组织的提取液。 •主要技术手段是核磁共振（NMR）、质谱（MS）、色谱（HPLC， GC）。 代谢组学的特点 •关注内源化合物 •对生物体系的小分子化合物进行定量定性研究 •上述化合物的上调和下调指示了与疾病、毒性、 基因修饰或环境因子的影响 •上述内源性化合物的知识可以被用于疾病的诊 断和药物筛选。 代谢组学研究方法 代谢组学的研究流程 自动进样 数据分析与可 样品的提取 样品预处理 化合物的分离 检测及鉴定 视化，建模与 仿真 光谱 生物信息学 固相微萃取 气相色谱 质谱 化学信息学 固相萃取 液相色谱 核磁共振 化学计量学 亲和色谱 毛细管电泳 电化学 计算生物学 目前常用的分离手段 •气相色谱与质谱联用(GC—MS) •液相色谱与质谱联用(LC—MS) •核磁共振(NMR) 气相色谱，质谱原理 气相色谱 质谱 气相色谱的流动向为惰性气体，气- 质谱分析是一种测量离子荷质 固色谱法中以表面积大且具有一定