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重组率=005 基因连锁分析
骨质疏松症的遗传学研究(part 2) Hong-Wen Deng, Ph.D. Osteoporosis Research Center Creighton University, Omaha, NE, USA 翻译者: violet39 (DXY) 基因连锁分析(1a) 基因连锁分析(1b) 595对独立的卵生同胞(Koller et al. 2000) 和包含630人的53个家系(Deng et al. 2002)的遗传度(power)分析 A:重组率=0 B:重组率=0.05 基因连锁分析(2) 基因连锁分析(3) 基因连锁分析(4) 基因连锁分析(5) 注解: 孪生同胞的遗传度(power)要求达到80%(当LOD为3.0时) 小鼠QTL定位 通过假定人类同源染色体定位进行 动物模型QTL分析 通过假定人类同源染色体定位进行 动物模型QTL分析 通过假定人类同源染色体定位进行 动物模型QTL分析 通过假定人类同源染色体定位进行 动物模型QTL分析 精细定位(~30cM到~1cM)(Deng et al., 2000)排除定位(Deng et al., 2001) 研究什么表型? 两个复杂性状间的相互关系 孤立研究危险因子的局限性(1) 非胰岛素依赖型糖尿病(NIDDM)(Ghosh et al. 2000):染色体20,11,2,10和6; 危险因子(Watanabe et al. 2000): 染色体3(禁食C-肽/葡萄糖),染色体10(急性胰岛素反应),染色体13(体重指数和2-h胰岛素),染色体17和19(实验胰岛素抵抗指数)。 心肌梗死(Broeckel et al., 2002):染色体14。 危险因子(Broeckel et al., 2002):染色体1和6(脂蛋白A),染色体14,17(低密度脂蛋白胆固醇浓度),染色体1(高密度脂蛋白胆固醇浓度),染色体9(甘油三酯浓度),染色体6(Ⅱ-型糖尿病),染色体6(收缩期高血压),染色体1(舒张期高血压)。 孤立研究危险因子的局限性(2) DNA微阵列分析 DNA微阵列分析举例 鉴定了在鼠间质祖细胞分化过程中,成骨细胞中被诱导的9个新基因和EST序列 (Vaes et al., 2002)。 蛋白质组学研究 ~30,000基因,150万蛋白; 分析基因产物功能(大规模鉴定或定位蛋白,并且研究蛋白-蛋白相互作用); 将基因表达和细胞代谢及功能以及遗传图谱联系起来。 致谢
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