测序技术进展绪论.ppt

成果：利用HeliScope测序仪，Quake博士本人的基因组报告发表在《Nature Biotechnology》上。他是继James Watson和Craig Venter之后第三位基因组测序的非匿名个体。经过4轮运行，他们产生了数十亿个序列读取，测序的覆盖度达28倍,覆盖了90%的人类参考基因组。序列读长24-70 bp,平均读长为32 bp,并鉴定出280万个SNP位点和752个拷贝数变异。这次测序花了4个星期的时间，试剂花费为48000美元。 Pacific Biosciences Pacific Biosciences公司致力于开发一种新的测序技术——单分子实时技术(single molecule real time,SMRT)。 这一单分子合成测序技术依赖于被称为零级波导(zero mode waveguide,ZMW)的纳米结构来实时观察DNA的聚合。 该结构在一片薄金属膜上刻出数以千计直径数十纳米的亚波长小孔.并将金属膜附着在透明的支持基质上.由于每个小孔的尺寸低于光的波长,所以当光线从透明一侧照射时无法透射.并且在每个小孔的底部形成指数衰减的消逝波,这样创造了一个很小体积的检测空间.每个小孔底部固定一个聚合酶分子. 激光在进入ZMW后迅速衰减，因此，只有底部30 nm被照亮，随后核苷酸涌入ZMW中，并在阵列表面扩散。当聚合酶检测到正确的核苷酸时，便将其