物信息学1 陈润生.pptVIP

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生物信息学1陈润生

人类有多少基因 2万—20万 28,000±4,000 Cell 106, 413-415, August 24, 2001 3万—4万 到目前为止已定位在染色体上的基因数目有14015个 (见/LocusLink/statistics.html); * 谢谢大家 * Ensembl Genome Browser Source: * * 2002年11月 WHO流感研究项目经理Klaus Stohr博士在北京参加关于中国流感——疫苗政策方面的会议。 一位来自广东的代表在会议报告提到,在广东靠近香港的地区有数人死于一种异常严重的流感。 * 2003年2月21日 这一天,这种新的病毒悄悄地从广东进入香港。 病毒的携带者是一位63岁的医生刘某,他到香港是为了参加一个婚礼。 而到了3月上旬,香港当局开始认识到,这种新的疾病正是从曾与刘医生接触过的几个人开始传染给香港、新加坡、越南的数百人,并最终传播到了美国。 * 2003年4月11日 这天晚上,Holt博士及其研究组意识到他们的路子终于走对了。 他们用计算机对DNA片断的测序结果进行分析,将各片断的碱基顺序拼合起来。 到4月12日凌晨2点25分,终于完成了第一个SARS嫌疑病原的基因组序列。 全研究室的人员都欢呼起来。 * 冠状病毒及其基因组 * 1965年,人類首次確認冠狀病毒可令人類出現感冒样症状。在本次SARS發生前,已發現兩種可傳於人體的冠狀病毒,但只會引發感冒。除此之外,其他冠狀病毒,多數只存活在豬、牛及雞等禽畜及哺乳類動物身上。本次的新型變種病毒,除了在人體內繁殖,亦會令免疫系統出現強烈反應,傷害自身組織。 Coronavirus is a family of positive, RNA, helical, enveloped, viruses that infect mammals and birds. 冠状病毒为球形RNA病毒,直径120~230nm。病毒颗粒表面围有花瓣样突起。這種病毒,過去只會引發人类感冒,但為甚麼會霎時間變得如此兇狠呢?另外,不同人感染這種肺炎病毒時,是否一定引發非典肺炎呢?這些謎團,將是未來醫學界、科技界研究的主要範圍。 * The capped and poly-adenylated genome is the largest of the RNA viruses and has a unique method of replication. These viruses have the ability to genetically recombine with other members of the coronavirus family. The genome encodes 3 or 4 different structural proteins. Human Coronavirus-OC43 encodes for hemagglutinin-esterase (HE) whereas HCV-229E does not. This protein causes red blood cells to clump together, and can be used to determine how much virus is in a sample. HE can also initiate binding. Human Torovirus also encodes for HE. All coronaviruses encode for a nucleocapsid protein (N). This protein binds to RNA and forms a helical nucleocapsid. It may be involved in the regulation of RNA synthesis. The membrane glycoprotein (M) is involved with envelope formation. The spike protein (S) is also responsible for binding to cells. The corona cycle link to the left explains the involvement of these proteins in each step of the dynamic phase. * SARS gen

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