可变数目串联重复序列分析与多位点序列分析在伯氏疏螺旋体分型 .pdf

·98 · 中国媒介生物学及控制杂志2013年4月第24卷第2期 ChinJVectorBiolControl,April2013,Vol.24,No.2 ·论 著· 可变数目串联重复序列分析与多位点序列分析 在伯氏疏螺旋体分型研究中的应用 1，2 2 2 2 2 1 周鑫 ，侯学霞 ，耿震 ，张琳 ，郝琴 ，赵素莲 1山西医科大学微生物与免疫教研室，山西太原030001；2 中国疾病预防控制中心传染病预防控制所莱姆病室，传染病 预防控制国家重点实验室，北京102206 摘要：目的 评价多位点可变数目串联重复序列分析（MLVA）和多位点序列分析（MLSA）两种方法在伯氏疏螺旋体分型 研究中的应用。方法 采用MLVA和MLSA两种方法对31株伯氏疏螺旋体分型结果进行比较分析。结果 31株伯氏疏 螺旋体用MLVA方法分成4簇，24个基因型，其中21个独立基因型，成簇率达24/31，MLVA的分辨率达到0.969；MLSA可 将31株伯氏疏螺旋体分成4簇，每株都可独立分析，但有3个节点步长值（Bootstrapvalue）＜50%。结论 MLVA和MLSA 两种方法均适合于伯氏疏螺旋体的分型研究，对于部分分型有异议的菌株，将MLVA与MLSA联合可有效进行伯氏疏螺 旋体的分型鉴定。 关键词：多位点序列分析；多位点可变数目串联重复序列分析；伯氏疏螺旋体；基因分型 中图分类号：R377 文献标志码：A 文章编号：1003-4692（2013）02-0098-05 Applicationofmultiple⁃locusVNTRanalysisandmulti⁃locussequence analysisingenotypingofBorreliaburgdorferisensulato 1，2 2 2 2 2 1 ZHOUXin ,HOUXue⁃xia,GENGZhen,ZHANGLin,HAOQin,ZHAOSu⁃lian 1DepartmentofMicrobiologyandImmunology,ShanxiMedicalUniversity,Taiyuan030001,ShanxiProvince,China;2StateKey LaboatoryforInfectiousDiseasesPreventionandControl, NationalInstituteforCommunicableDiseaseControlandPrevention, ChineseCenterforDiseaseControlandPrevention,Beijing 102206,China Correspondingauthors:ZHAOSu⁃lian,Email:zhao_sulian@163.com;HAOQin,Email:haoqin@ SupportedbytheNationalNaturalScienceFoundationofChina （NoandNationalScienceandTechnologyMajor ProjectforInfectiousDiseaseinChina （No.2013ZX10004-001） Abstract:Objective Toevaluatetheapplicationofmultiple⁃locusvariable⁃numbertandem⁃repeat(VNTR)analysis(MLVA) andmulti⁃locussequencea