教案植物dna.pptVIP

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教案植物dna

植物DNA的提取 * 基本原理 DNA提取 DNA纯化 操作步骤 注意事项 * 核酸的分类及存在 脱氧核糖核酸(DNA)、核糖核酸(RNA) 与蛋白质结合在一起以 核蛋白(DNP)的形式存在。 在制备核酸时通常 破坏细胞壁及细胞膜来使 核蛋白释放出来。 * 核酸的理化性质 DNA为白色类似石棉样的纤维状物,RNA的纯品呈白色粉末或结晶。核酸和核苷酸大都呈酸味。 DNA、RNA和核苷酸都是极性化合物,一 般都溶于水,不溶于乙醇、氯仿等有机溶 剂,它们的钠盐比游离酸易溶于水。 在酸性溶液中,核酸易水解,中性或弱碱性溶液中较稳定。 * 由于生物材料的差异,不可能有一种普遍适用的提纯生物体DNA的方法,植物材料有坚固的细胞壁,核酸含量较少,含有较多的多糖物质和色素、核酸酶活性高等这些因素给植物DNA的分离纯化带来了困难。 * DNA提取 SDS法 SDS是一种已知的能够使蛋白质变性的去污剂。它用于确定蛋白分子量的聚丙烯酰胺凝胶电泳。它也可以用于核酸抽提操作中破坏细胞壁及裂解核酸-蛋白复合物。在较高温度下,破坏蛋白质与DNA的结合,使DNA释放出来。SDS是有效的阴离子去垢剂,细胞中DNA与蛋白质之间常借静电引力或配位键结合,SDS能够破坏这种价键。 十二烷基硫酸钠 * CTAB法: CTAB:十六烷基三甲基溴化铵,是一种阳离子去污剂,可溶解细胞膜与脂膜,使细胞中的DNA-蛋白质复合物释放出来,并使蛋白质变性,使DNA与蛋白质分离。它能与核酸形成复合物。 在高盐溶液中(≥0.7mol/L NaCl)是可溶的,当降低溶液盐浓度到一定程度(0.3mol/L NaCl)时,从溶液中沉淀,通过离心就可将CTAB与核酸的复合物同蛋白质、多糖类物质分开,然后将CTAB与核酸的复合物沉淀溶解于高盐溶液,再加入乙醇使核酸沉淀,CTAB能溶解于乙醇随之被除去。 * 与SDS法相比 CTAB法的最大优点是能很好地去除糖类杂质,对于含糖较高的材料可优先采用。 该方法另一个特点是在提取的前期能同时得到高含量的DNA及RNA,如果后继实验对二者都需要,则可分别进行纯化,如只需要DNA则可用RNase水解掉RNA。 * CTAB溶解细胞膜,并结合核酸,使核酸便于分离。 Tris-HCl (pH8.0) 提供一个缓冲环境,防止核酸被破坏。 NaCl 提供一个高盐环境,使CTAB与核酸形成的复合物充分溶解,存在于液相中。 EDTA(乙二胺四乙酸)螯合Mg2+ 或Mn2+ ,抑制DNase活性。 β- 巯基乙醇是抗氧化剂,有效地防止酚氧化成醌,避免褐变,PVP-K30(聚乙烯吡喏烷酮)可以降低酚化合物的离子化,使酚容易去除。 CTAB提取缓冲液中各试剂的作用: * 注意 β- 巯基乙醇有很高的毒性,吸入 、摄入或经皮肤吸收后会中毒。 中毒表现有呕吐、震颤、头痛、昏迷,甚至死亡。对眼、皮肤有强烈刺激性。可引起角膜混浊。 * DNA纯化(去杂质) 蛋白质 常用苯酚:氯仿:异戊醇(25:24:1)或氯仿:异戊醇(24:1)抽提。 RNA 常选用RNase消化 酚类物质 提取液中加少量巯基乙醇。 多糖 提取液中加PVP。 聚乙烯吡咯烷酮, 是一种非离子型高分子化合物 * * 操作步骤 1.称取 200-300mg 叶片装入 1.5ml 离心管,置于液氮中,用研磨棒研磨至粉碎,然后向离心管中加入 1000μl 经过 65℃预热、含有 2%PVP 的 CTAB提取液和10μlβ-疏基乙醇,混匀;在 65℃下水浴 40min-1h 其间要经常颠倒混匀。 2. 加入 200μl 醋酸钾,混匀,冰浴 15min。10000rpm 离心 10min,取上清约900μl。 * 3、加入等体积的 Tris 饱和酚-氯仿-异戊醇(25:24:1),在摇床上充分摇动15min;10000rpm 离心10min,取上清 700μl。 4、加入 1/10 上清液体积的 Rnase,混匀;37℃水浴 40min-1h。 5、加入等体积的的氯仿-异戊醇(24:1),摇床上摇动 15min;10000rpm 离心10min,取上清约 500μl。 * 6. 加入 1/10 体积的醋酸钠,2 倍体积的无水乙醇,充分混匀,4℃冰箱中静置20min。 7. 10000rpm 离心 10min,弃上清。 8. 分别用 75%酒精和无水乙醇漂洗沉淀 2 次,倒掉酒精,将离心管管口朝下,自然晾干。 9. 加入 100μl 1×TE 溶液溶解 DNA,也可以 50℃助溶,保存在 4℃备用。 * * * 注意事项 1)选取新鲜材料,研磨迅速彻底,研磨好的材料应与 CTAB

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