单细胞研究渐成关注焦点.pdfVIP

单细胞研究成关注焦点： 近两年，基于细胞组学，特别是单细胞组学研究的精准医疗领域越来越受到政府和科学家 们的重视。今年3 月8 日，科技部下发了国家重点研发计划2016 年度项目申报指南的通知，其 中“精准医学研究”作为其中之一被列入优先启动的重点专项，未来五年将受到国家重点扶持。 该项目提出：要通过对单细胞组学技术的研发，建立单细胞的高通量快速分离、捕获、提取、 及测序技术，从而深入推进单细胞技术在重大及罕见疾病临床研究和治疗中的应用。并通过人 群队列研究等手段，整合获取的精准医学大数据，建立合理规范的管理、保存、共享机制，进 而实现和完善疾病防治方案的个性化、精准化研究。 同时，指南中明确指出：作为上述研究的目标和基础，建成“单细胞捕获富集技术”、“单 个细胞基因组的均匀、无偏、精准扩增和高通量测序技术”和“整合的单细胞多组学高通量测 序技术”等将作为项目的考核指标。 今年2 月份，北京大学汤富酬、黄岩谊与首都医科大学彭吉润课题组间合作，在单细胞多 组学测序领域实现重大突破，在世界范围内首次实现了单细胞水平的基因组、转录组、表观基 因组的三重组学测序。利用这一新技术，研究人员对源自一个肝癌病人的25 个单细胞的CNVs、 DNA 甲基化组和转录组进行了检测分析，成功鉴别出了这些细胞内的两个亚群，从而为肿瘤的 个性化精准治疗提供了大量数据基础。 国际上，科学家们也将目光越来越多地投向单细胞研究。就在科技部公布 “精准医学研究” 作为未来五年国家重点研发计划的同时，3 月9 日到11 日为期3 天的单细胞生物学大会在英国 召开。来自世界各国的科学家就包括肿瘤、免疫、干细胞、精准治疗等多个热点研究领域进行 了广泛交流。通过检测细胞异质性、基因组学和精准表征等手段，深入了解细胞基因、表观、 功能的变化，重大疾病如急性白血病（AML、ALL ）的病理机理，肿瘤个性化治疗中特异性靶点 的筛选等议题受到了参会人员的关注。另一方面，如何在单细胞水平实现快速的高通量样本捕 获制备，提高单细胞测序、基因表达、分型等研究方法的数据量，从而进一步确保实验数据的 有效性和准确性，并进行大规模数据统计分析，推进单细胞技术在临床研究和治疗中的应用也 成为大家讨论的另一焦点话题。会上科学家们通过讲座、海报等形式展示了各自的实验成果， 其中不少研究项目中提出借助Fluidigm 公司的自动化单细胞制备平台，可以快速、稳定实现单 细胞的高通量分离、捕获、制备、预扩增，大大提高了实验数据量和效率，缩短了实验时间（见 表一）。 表一 Research field Poster Poster Title Application Fluidigm Presenter product  Developmental Arsham Single Cell mRNA-seq Unveils  Single-cell signaling C1 biology Ghahramani Non-autonomous Effect of  Combining mRNA sequencing to  Stem cell biology Epidermal Wnt/beta-cantenin high content cell imaging  mRNA-Sequencing singalling  Cardiovascular Helle F. Transcriptional heterogeneity of  Single-