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利用肾小球全基因组表达数据筛选治疗糖尿病肾病的药物.PDF
肾脏病与透析肾移植杂志 第24卷 第3期 2015年06月 ·249 ·
利用肾小球全基因组表达数据筛选治疗
糖尿病肾病的药物
史文潮 施劲松 蒋 松 邱丹丹 王 晓 刘志红
摘 要 目的:利用 2 型糖尿病肾病(T2DN)患者微分离的肾小球全基因组表达数据,借助关联性图谱
(CMAP)数据库和生物信息学方法,探寻具有T2DN治疗作用的潜在药物。 方法:选取中国汉族T2DN患者23
例和正常对照6例,微分离肾小球,利用Affymetrix U133 Plus20全基因组表达谱芯片检测获得基因表达数据,获
得T2DN患者不同分期之间的差异表达基因后,进一步通过2种不同的生物信息学方法寻找T2DN 的潜在治疗药
结果: 志
物,并阐明其可能的分子作用机制。 利用T2DN晚期和早期相比的差异表达基因和CMAP数据库,筛选出
小白菊内酯(parthenolide)、荜茇酰胺(piperlongumine)、15⁃脱氧前列腺素J2(15d⁃PGJ2)和LY⁃294002(PI3K抑制剂)
等候选药物。 上述药物能够逆转T2DN患者在疾病进展过程中肾小球基因表达的变化,提示这些药物可能具有治
杂
疗T2DN的潜能。 既往研究证实这些药物对T2DN有一定的治疗作用,验证了该药物筛选方法的可靠性。 结
论:利用T2DN患者肾小球全基因组表达谱和CMAP数据库能够快速筛选出具有T2DN治疗潜能的药物,候选药
植
物可进行下一步的动物实验和临床试验以证实其治疗的安全性和有效性,应用前景广阔。
关键词 糖尿病肾病 全基因组表达谱 关联性图谱 药物筛选
移
Exploration of potential drugs for diabetic nephropathy with the genome⁃wide expression data
SHI Wenchao,SHI Jingsong,JIANGSong,QIUDandan,WANGXiao,LIUZhihong
肾
National Clinical Research Center of Kidney Diseases,Jinling Hospital,Nanjing University School of Medicine,Nanjing
210016,China 析
Corresponding author:LIUZhihong(E⁃mail:liuzhihong@nju.edu.cn)
ABSTRACT Objective:To investigate potential drugs for diabetic nephropathy (DN) using whole⁃genome
透
expression profile and the Connectivity Map (CMAP). Methodology:Twenty three Chinese Han DN patients and six
normal controlswere included in this study. Whole⁃genome expression profiles of micro⁃dissected glomeruli were measured
using the Affymetrix human U133plus20 chip. Differenti
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