多巴胺d3r蛋白同源模建及其应用 - 四川理工学院学报.pdf

第２５卷第１期 四川理工学院学报（自然科学版） Ｖｏｌ２５　Ｎｏ１ ２０１２年２月 ＪｏｕｒｎａｌｏｆＳｉｃｈｕａｎＵｎｉｖｅｒｓｉｔｙｏｆＳｃｉｅｎｃｅ＆Ｅｎｇｉｎｅｅｒｉｎｇ（ＮａｔｕｒａｌＳｃｉｅｎｃｅＥｄｉｔｉｏｎ） Ｆｅｂ２０１２  文章编号：１６７３１５４９（２０１２）０１００２２０５ 多巴胺 Ｄ３Ｒ蛋白同源模建及其应用 １ ２ 马丽英 ，徐四川 （１．凯里学院环境与生命科学学院，贵州 凯里５５６０１１；２．云南大学化学科学与工程学院，昆明６５００９１） 　　摘　要：以分辨率为２２?的牛视紫红质蛋白的晶体结构为模板，采用同源模建方法，建立Ｄ３Ｒ模 蛋白。对接Ｄ３Ｒ模蛋白与刺桐属配体分子，在对接的Ｄ３Ｒ蛋白的结合腔中选定一个以药物分子为质 心，以半径为６?的空间范围，计算此空间范围内的所有氨基酸残基与配体分子的作用能量，即残基／配 体的结合能或排斥能，据此得到配体分子与受体蛋白的活性结合位点。 关键词：同源模建；分子对接；多巴胺第三受体 中图分类号：Ｏ６４ 文献标识码：Ａ 　　多巴胺（ＤＡ）是一种重要的神经递质，由于ＤＡ受体 ｄｏｐｓｉｎ之间的序列一致性和相似性。 亚型的多样性、脑区分布的特异性及其所处突触环境的 用Ｓｙｂｙｌ７２技术［２－３］，去掉牛视紫红质蛋白（ｒｈｏ 功能差异性，使得脑内ＤＡ系统成为复杂系统，协调地参 ｄｏｐｓｉｎ）中的Ｂ链，只留下 Ａ链及周围一些小分子。将 与运动功能、认知活动和药物成瘾等生理、病理的调控 牛视紫红质蛋白（ｒｈｏｄｏｐｓｉｎ）中的氨基酸残基由Ｄ３受体 过程。精神分裂症、帕金森病的防治和毒品成瘾机制都 的氨基酸残基代替，即序列替换。 是神经科学中倍受关注的研究领域，它们都与ＤＡ系统 表１ ｒｈｏｄｏｐｓｉｎ与Ｄ３受体序列联配表 密切相关；ＤＡ受体则是神经药理研究中活跃领域之一。 蛋白 受 蛋白数据 序列 体 多巴胺受体分为Ｄ１、Ｄ２、Ｄ３、Ｄ４和Ｄ５多种受体亚 Ｒ ３５ ６４ Ｗ ＱＦＳＭＬＡＡＹＭＦＬＬＩＭＬＧＦＰＩＮＦＬＴＬＹＶＴＶＱ 型。其中Ｄ１和Ｄ２受体亚型被统称为Ｄ１样受体，Ｄ２、 ＴＭ１ Ｄ ２７ ５６ ３ Ｒ ＰＨＡＹＹＡＬＳＹＣＡＬＩＬＡＩＩＦＧＮＧＬＶＣＡＡＶＬＲ ［１］ Ｄ３、Ｄ４受体亚型被统称为Ｄ２样受体 。