分子模拟用于尤文肉瘤ews-fli1 蛋白hla-a21 限制性ctl 表位的 .pdfVIP

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2017-09-02 发布于天津
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分子模拟用于尤文肉瘤ews-fli1 蛋白hla-a21 限制性ctl 表位的 .pdf

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分子模拟用于尤文肉瘤ews-fli1 蛋白hla-a21 限制性ctl 表位的

2010 年第 68 卷化学学报 Vol. 68, 2010 第 13 期, 1277～1284 ACTA CHIMICA SINICA No. 13, 1277～1284 ·研究论文· 分子模拟用于尤文肉瘤 EWS-FLI1 蛋白 HLA-A2.1 限制性 CTL 表位的筛选曹凯*,a 黄路#,b 林治华c 舒勇a 韩智敏a 黄山虎a 廖翔a 王远强c 彭方毅c 安洪d (a 南昌大学第一附属医院南昌 330006) (b 江西省妇幼保健院南昌 330006) c ( 重庆理工大学化学与生物工程学院重庆 400050) (d 重庆医科大学附属第一医院重庆 400016) 摘要为获得尤文肉瘤 EWS-FLI1 融合蛋白有效的 HLA-A2.1 限制性CTL 表位, 综合运用 BIMAS, SYFPEITHI, Predep 和 IEDB 方案对 EWS-FLI1 进行 CTL 表位的预测, 得出 8 个 CTL 表位 9 肽序列; 应用多项式方案、量化基序方案对 8 个表位 9 肽进一步进行筛选, 获得其中 4 个 9 肽序列, 并进一步运用分子模拟方法初步模拟了 4 个表位肽与 HLA-A2.1 分子间的相互结合作用; 应用标准 Fmoc 方案合成 CTL 表位肽, RP-HPLC 与 MS 分别鉴定合成肽的纯度与分子量; 通过亲和力实验验证了表位肽QIQLWQFLL(EWS-FLI1 304)与HLA-A2.1 有较强的结合力, 从而为表位肽的后继免疫学特性研究提供了基础. 本研究提供了一个合理高效的表位筛选方法. 关键词尤文肉瘤; EWS-FLI1 融合蛋白; CTL 表位; 分子动力模拟 Screening of HLA-A2.1-Restricted CTL Epitopes Derived from Ewing’s Sarcoma EWS-FLI1 Fusion Protein by Using Molecular Simulation Cao, Kai*,a Huang, Lu#,b Lin, Zhihuac Shu, Yonga Han, Zhimina Huang, Shanhua Liao, Xianga Wang, Yuanqiangc Peng, Fangyic An, Hongd a ( The First Affiliated Hospital of Nanchang University, Nanchang 330006) (bJiangxi Maternal and