药用野生稻复合体itsl和its2序列 - ingenta connect.pdfVIP

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2017-09-02 发布于天津
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药用野生稻复合体itsl和its2序列 - ingenta connect

植物遗传资源学报2011，12(3)：442—447 JournalofPlantGeneticResources 药用野生稻复合体ITSl和ITS2序列变异及其系统进化分析龚汉雨，刘如亮，董正伟，刘虹，覃瑞，李刚 (中南民族大学生命科学学院／陶家民委生物技术蓖点实验室。湖北武汉430074) 摘要：通过PeR扩增并测序分析稻属药用野生稻复合体5个野生稻种基因组完整的ITS区及5．8s区，并与栽培稻ITS序列进行比较，构建分子系统进化树。探讨了稻属药用野生稻复合体内不同种间的亲缘关系和系统进化。结果表明，ITSI和 ITS2均有较高的G／C含量，ITSI序列的长度多态性相对较高，ITS2序列的碱基突变频率较高。药用野生稻和高秆野生稻亲缘关系很近，而与栽培稻亲缘关系较远；短药野生稻、斑点野生稻、澳洲野生稻与药用野生稻亲缘关系渐近，处于进化的过渡阶段。关键词：药用野生稻复合体；系统进化分析；ITS序列 of PhylogeneticAnalysisOryzaofficinalisComplex Basedon ITSl ITS2 Ribosomeand Sequences GONG Rut，LI Han-yu，LIURu-liang，DONGZheng·Wet，LIUHong，QIN Gang StateEthnic Commission Sciences， (KeyLaboratoryof Affairs forBiologicalTechnology／CollegeofLife South—Central Nationalities。Wuhan430074) Universityfor rice andtwocultivatedricevarietieswere wild inthe Abstract：Five 0．officinalis phylogenet— species complex onthe ic basedontheribosomeITSlandITS2 ITSandthe5．8S ri— complete sequem：es analyzed sequences．Their bosome were chainreaction andwere onlinesoftwareCLUST— region amplifiedbypolymerase technique analyzedby AL and resultsshowedtheITS allhad W(2．0．12)MultipleSequenceAlignmentsNeighborJoining．The sequences the11’S2had G／C I