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种子发育相关B3基因的起源及进化
目录
摘 要 ……,……l
A b strac t…… 111
第 一章 引言……1
1.1 种子形 成和 发育 ……1
1.1.1 种 子 形成 和 发育过程 概述 ……1
1.1.2 种 子成 熟 发育调 控 网络 ……,……2
1.2 基 因家族 的形成与进 化 ……3
1.3 B 3 超 家 族 A FL 亚家族 基 因与种子 发育 ……4
1.4 本项研 究 的 目的与 意义 ……,……7
第二 章 A FL 亚家族 B 3 基 因的起 源 与分子进 化研 究 ……9
2.1 材料 与方法 ……9
2.1.1 研 究材料 ……9
2.1.2 序 列获取 ……9
2.1.3 序 列 比对 和基 因结构域 分析 ……11
2 .1.4 A FL 亚 家族 B 3 基 因 内含 子 丢 失和 插入 分析 ……11
2.1.5 系 统 发 育 分析 ……11
2.2 研 究结果…… ..‘……13
2.2 .1A F L 亚 家 族 成 员 在 陆生 植物 基 因组 中的分布 ……13
2.2.2 A FL 亚 家族成 员 的系 统 发育关 系分 析 ……14
2 .2 .3 A F L 亚 家 族 成 员保 守 区差异 分析 ……,……20
2.2.4 A F L 亚 家族成 员外显 子 一内含 子 结构变化 分 析 ..…,……23
2 .3 讨 论 …,……,……26
2 3.1A F L 亚 家族 B 3 基 因 的起 源 与 陆生 植物 主 要类 群 系 统 发生 的关系 26
2 .3.2 A FL 亚 家族进 化 史 中 的基 因重 复和 分化 式 样 ……26
2.3.3 A FL 亚 家族成 员保 守结构域 数 目逐步减少 的潜 在 意 义 ……27
2 .3.4 禾 本科 植 物 中 A F L 亚 家族 B 3 基 因的结构 与功 能分 化 分 析 ...……28
第 _ 几章 裸 子 植 物 草 因组 中 A F L 亚 家 族 B 3 基 因 的妇“增 ……犯
3.1 引 台-……,……,..……32
3.2 材 料和 方法 ……犯
3 .2 .1 研 究材料 ……犯
3 .2 .2 总 D N A 提 取 ……32
3.2 .3 PC R 扩 增 和测 序 ……33
3.3 实验 结果……40
3.3.1 松 杉 纲 植 物 A F L B 3 基 因扩 增 结 果 ……40
3.3.2 银 杏 A FL B 3 基 因扩 增 结 果 ……43
3 .4 讨 论 ……4 7
第 四章 结论 与展望 ……,……48
参 考 文 献 ……49
附录 工植 物 基 因组 中 A FL 亚家族 B 3 基 因 的相 关 信 息 ……62
附录 11裸 子 植物 A F L 基 因 1人IL 一P C R 扩 增 序 列 ……64
附录 m 攻 读 硕 士 学 位 期 间 已发表 论 文 ……,…… “
致 谢 ……81
摘 要
种 子 形成 (seed form ation ) 是 陆生植 物进 化 的关 键 创 新 (key innovation )
之 一 ,也 是种 子 植物 广 泛适应 不 同陆地 环 境井 发展成 为 陆地 植被 主要 类 群 的基
础 。从系统发育 的角度 看 ,种 子 的形 成 实 际是 由于在 高等植 物 生活 史 中、在胚
胎 发生 的后期插 入 了一 个成 熟 阶段所致 。B 3 类 转 录 因子 在植 物 基 因组 中形成 一
个超 家族 ,包括 : LA V 家族 、A R F 家族 、RA V 家族和 R EM 家族
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