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一、口腔粘膜脱落细胞采集二、口腔拭子基因组DNA 提取(天根Kit
一、口腔粘膜脱落细胞采集
注意:为了保证样本不被食物或者饮料污染,取样前 30min 内请勿进食和饮
水。
1、洗净双手;
2、取出棉签;
3 、手持棉签,伸进口腔,从口腔内侧颊粘膜处(腮帮子内侧)反复擦拭 40
次以上(不时旋转棉棒),取出棉签;
4 、从试管盒中取出试管,打开管盖,将棉签头部伸入管中,用力掰断,将
棉签头部留在管内,并扣紧管盖。
二、口腔拭子基因组 DNA 提取(天根 Kit ,DP322)
使用前,请先在缓冲液 GD 和漂洗液 PW 中加入无水乙醇,加入体积请参照
瓶上的标签。
1. 处理材料:
将在面颊内擦拭过的棉签转置于 2ml 离心管中,用剪刀将棉签部分从其杆
上剪下,加入 600ul 缓冲液 GA。
注意:如果需要去除RNA,可加入4 μl RNase A(100 mg/ml)溶液(客户自备 ,
目录号:RT405-12) ,振荡15 sec ,室温放置5 min。
2. 加入40ul Proteinase K溶液,涡旋10 sec混匀,56°C放置20 min,其间每7
min涡旋混匀数次。
3. 加入600ul缓冲液GB,充分颠倒混匀,70°C放置10 min。此时溶液应变清
亮,简短离心以去除管盖内壁的液滴,然后挤压去除拭子,将尽可能多的裂解液
转移至新的离心管中。
注意1: 加入缓冲液GB时可能会产生白色沉淀,一般70°C放置时会消失 ,不
会影响后续实验 。如溶液未变清亮 ,说明细胞裂解不彻底 ,可能导致提取DNA
量少和提取出的DNA不纯 。
注意2: 如果由于拭子上细胞数少导致提取的基因组DNA少于1 μg ,可以在
添加缓冲液GB的同时添加Carrier RNA(客户自备 ,目录号:RT416)。
4. 加300ul无水乙醇,充分颠倒混匀,简短离心以去除管盖内壁的液滴。
注意:加入无水乙醇后可能会出现絮状沉淀 ,但不影响DNA提取 。
5. 将上一步所得溶液和絮状沉淀都加入一个吸附柱CR2中(吸附柱CR2放入
收集管中) , 12,000 rpm (~13,400×g)离心30 sec,倒掉收集管中的废液 ,将吸附
柱CR2放回收集管中 。
注意:第4步液体总体积超过800ul,分两次转移。
6.向吸附柱CR2中加入500 μl缓冲液GD(使用前请先检查是否已加入无水乙
醇) ,12,000 rpm (~13,400×g)离心30 sec,倒掉收集管中的废液 ,将吸附柱CR2
放回收集管中 。
7. 向吸附柱CR2中加入600 μl 漂洗液PW(使用前请先检查是否已加入无水
乙醇) ,12,000 rpm (~13,400×g)离心30 sec,倒掉收集管中的废液 ,将吸附柱CR2
放回收集管 。
8. 重复操作步骤7。
9. 12,000 rpm (~13,400×g)离心2 min,倒掉废液 。将吸附柱CR2室温放置数
分钟 ,以彻底晾干吸附材料中残余的漂洗液。
注意: 这一步的目的是将吸附柱中残余的漂洗液去除 ,漂洗液中乙醇的残留
会影响后续的酶反应(酶切、PCR等)实验。
10. 将吸附柱CR2转入一个干净的离心管中,向吸附膜中间位置悬空滴加
20-50 μl 洗脱缓冲液TB ,室温放置2-5 min,12,000 rpm (~13,400×g)离心2 min。
注意:洗脱缓冲液体积不应少于20 μl ,体积过小影响回收效率 。为增加基因
组DNA的得率,可将离心得到的溶液再加入吸附柱CR2中,室温放置2 min ,
12,000 rpm (~13,400×g)离心2 min。洗脱液的pH对于洗脱效率有很大影响 。若
用ddH2O做洗脱液应保证其pH值在7.0-8.5范围内 ,pH值低于7.0会降低洗脱效
率;且DNA产物应保存 在-20°C ,以防DNA降解。
DNA浓度及纯度检测
得到的基因组DNA片段的大小与样品保存时间、操作过程中的剪切力等因素
有关。回收得到的DNA片段可用琼脂糖凝胶电泳和紫外分光光度计检测浓度与纯
度。
DNA应在OD260处有显著吸收峰,OD260值为1相当于大约50 μg/ml双链
DNA、40 μg/ml单链DNA。
OD260/OD280比值应为1.7-1.9,如果洗脱时不使用洗脱缓冲液,而使用
ddH2O,比值会偏低,因为
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