毛丹青,罗美中.PDF

中国农业科技导报，2010，12(3)：103—107 JournalofAgriculturalScienceandTechnology 水稻培矮 64S(PA64S)基 因组 BAC文库的构建与分析 毛丹青， 罗美中 (华中农业大学作物遗传改良国家重点实验室，武汉430070) 摘 要：9311和培矮64S(PA64S)分别是我国超级杂交稻两优培9(LYP9)的父母本，9311的基因组已由北京 基因组研究所测序，而PA64S至今仍无任何可供公众使用的基因组资源，对 PA64S基因组的研究将有助于对 9311和PA64S这对亲本基因组的比较研究和其上优 良基因的克隆，为LYP9的基因组研究提供帮助。以水稻 PA64S的幼嫩叶片作为材料 ，为该品种构建了第一个高覆盖率、高质量的BAC文库。该文库一共有37632个 克隆，平均插入片段为 138kb，覆盖水稻全基因组 12倍左右 ，空载率仅为 1．5％，线粒体和叶绿体污染率仅分 别为0．35％和 1．85％。该文库克隆被存放于98个384孔板中并储存在一80~C冰箱中，将作为公共基因组资 源向研究者开放。 关键词：水稻；PA64S；细菌人工染色体 ；基因组文库 doi：10．3969／j．issn．1008-0864．2010．03．18 中图分类号：Q785 文献标识码：A 文章编号：1008-0846 (2010)03-0103-05 Construction andAnalysisofaBAC Libraryof RicePA64SGenome MAO Dan—qing，LUO Mei—zhong (NationalKeyLaboratoryofCropGeneticImprovement，HuazhongA culturalUniversity，Wuhan430070，China) Abstract：931landPA64SarethepaternalandmaternalcuhivarsofthesuperhybridriceLYP9，respectively．The 9311genomehasbeensequencedbyBeijingGenomicsInstitute(BGI)．However，forPA64S，noanypublic genomicresourceiSavailableto date．Researchon PA46 Sgenomewillhelp in comparativestudiesbetween and cloningofagricuhurallyimportantgenesfrom thetwoparentalgenomes9311andPA64S，facilitatingthestudieson LYP9genome．Inthispaper，thefirstlargeinsert anddeepcoverageBAC libraryf0rP 孓4Swasconstructed，taking theyoungtenderleafbladeofPA64Sasmateria1．Thelibrarycontains37632 cloneswithanaverageinsertsizeof 138kb．representingnearly12一foldofricegenome．rheempty—vectorrateisonly1．5％ andthemitochondrialand chloroplastDNA contaminationratesare0．35％ and1．85％ ．respectively．Thecloneshavebeendepositedin98of 384wellplatesand stored at 一80oC freezers．and are accessibletoresearch communitiesasapublic genome resource ． Keywords：rice；PA46 S；BAC；genomicDNA library