杜仲MEP途径系列基因的基因结构预测.PDF

第31 卷 第4 期 经 济 林 研 究 Vol. 31 No.4 2013 年12 月 Nonwood Forest Research Dec. 2013 杜仲MEP途径系列基因的基因结构预测 刘慧敏 1a, 1b ，乌云塔娜 2,3 ，杜红岩 2,3 （1. 中南林业科技大学a. 经济林育种与栽培国家林业局重点实验室；b. 林学院，湖南 长沙 4 10004 ； 2. 中国林业科学研究院 经济林研究开发中心，河南 郑州 450003 ； 3. 国家林业局 杜仲工程技术研究中心，河南 郑州 450003 ） 摘 要：为深入了解杜仲MEP 途径基因的功能，以杜仲转录组和基因组序列为基础，预测了MEP 途径系列基 EuDXS 因基因组全长为9 455 bp ， 因的基因结构，包含两端非编码区、内含子和外显子的确定。结果表明： 2 基 5′ ′ EuDXR 包含9 个内含子和10 个外显子， 端非编码区和3 端非编码区的长度分别为1 853 bp 和2 000 bp ； 基 ′ ′ 因的基因组全长6 822 bp ，包含11 个内含子和12 个外显子，5 端非编码区和3 端非编码区的长度为1 120 bp EuCMK ′ ′ 和2 163 bp ； 基因的基因组全长为19 835 bp ，包含10 个内含子和11 个外显子，5 端非编码区和3 端 EuMDS 非编码区的长度分别为5 000 bp 和424 bp ； 基因的基因组全长为11 771 bp ，包含2 个内含子和3 个外 ′ ′ EuHDS 显子，5 端非编码区和3 端非编码区的长度均为5 000 bp ； 基因的基因组全长为13 359 bp ，包含18 个 ′ ′ EuHDR 内含子和19 个外显子，5 端非编码区和3 端非编码区的长度均为2 000 bp ； 基因的基因组全长为7 844 ′