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lec2_shelx_SHELX压缩包
SHELX 程序系统
压缩包里所有程序由George M. Sheldrick编写
• SHELXS (XS) 通过直接法或帕特森法(重原子法)计算结构模型
• SHELXD (XM ) 通过高级直接法计算结构模型
• SHELXL (XL ) 结构精修
• SHELXH (XH ) 如果不是多参数的话与SHELXL同
• CIFTAB (XCIF ) 根据.cif文件产生发表论文所需的表格
• SHELXPRO (XPRO ) XL程序与蛋白质结构分析的常用软件之间的
界面软件
• SHELXWAT (XWAT )自动寻找水分子的位置
• SGHELXA …
见http://shelx.uni-ac.gwdg.de/SHELX
SHELXTL: SHELX 的商业Twin ;包括上述程序以及XPREP ,XP ,
PLATON (Ton Spek编写),XSHELL
SHELX的历史见George Sheldrick在Müller部分的前言。
引自George M. Sheldrick,同意使用。
数据流程
name.hkl
name.ins SHELX name.lst
name.fcf
name.cif XCIF
name.pdb
Editor or XP name.res etc.
name.rtf
Ray tracer name.bmp
Paper/
Grant proposal
1
用SHEXLS进行结构解析
SHEXLS是自动化程度很高的黑匣子。
PATT 解出一个Patterson解,尤其适合很多的轻
原子结合少数重原子组成的结构。对中心对称空间
群非常有效。
TRFF 用直接法。需要原子分辨率(1.2Å或更
好)。见:Sherick, G.M. Acta Cryst. Sect.
A(1990),46,467. 直接方法当存在反转中心时有问
题。(用PATT法或在非中心对称的空间群求解,并
人工转换)。有时可以用TREF1000 (或5000 )帮
助。
用SHELXS进行结构解析
2
用SHELXS进行结构解析
用直接法进行1000次循环。超过5000次没实际意义。
难处理时,试试ESEL或TEXP (见手册)或用SHELXD (XM ),
更容易些。
用SHELXS进行结构解析
紧跟一个负数的TREF根据已知代码生成唯一解。
(之前运行的SHELX的.Lst 文件中可找到)。
有时在低对称性的空间群中也可以得到结构。(P1 不是P-1)。
3
用SHELXD进行结构分析
SHELXD也是一个黑匣子,但有些不够自动化。
FIND n 产生n个随机原子。不对称结构中,会比预
期的少约25% 的原子。
PLOP 扩展循环过程中原子数,比预期的原子多,
用3-5次循环。
MIND 确定独立原子和等效原子间距(例如结合
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