lec2_shelx_SHELX压缩包.pdfVIP

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lec2_shelx_SHELX压缩包

SHELX 程序系统 压缩包里所有程序由George M. Sheldrick编写 • SHELXS (XS) 通过直接法或帕特森法(重原子法)计算结构模型 • SHELXD (XM ) 通过高级直接法计算结构模型 • SHELXL (XL ) 结构精修 • SHELXH (XH ) 如果不是多参数的话与SHELXL同 • CIFTAB (XCIF ) 根据.cif文件产生发表论文所需的表格 • SHELXPRO (XPRO ) XL程序与蛋白质结构分析的常用软件之间的 界面软件 • SHELXWAT (XWAT )自动寻找水分子的位置 • SGHELXA … 见http://shelx.uni-ac.gwdg.de/SHELX SHELXTL: SHELX 的商业Twin ;包括上述程序以及XPREP ,XP , PLATON (Ton Spek编写),XSHELL SHELX的历史见George Sheldrick在Müller部分的前言。 引自George M. Sheldrick,同意使用。 数据流程 name.hkl name.ins SHELX name.lst name.fcf name.cif XCIF name.pdb Editor or XP name.res etc. name.rtf Ray tracer name.bmp Paper/ Grant proposal 1 用SHEXLS进行结构解析 SHEXLS是自动化程度很高的黑匣子。 PATT 解出一个Patterson解,尤其适合很多的轻 原子结合少数重原子组成的结构。对中心对称空间 群非常有效。 TRFF 用直接法。需要原子分辨率(1.2Å或更 好)。见:Sherick, G.M. Acta Cryst. Sect. A(1990),46,467. 直接方法当存在反转中心时有问 题。(用PATT法或在非中心对称的空间群求解,并 人工转换)。有时可以用TREF1000 (或5000 )帮 助。 用SHELXS进行结构解析 2 用SHELXS进行结构解析 用直接法进行1000次循环。超过5000次没实际意义。 难处理时,试试ESEL或TEXP (见手册)或用SHELXD (XM ), 更容易些。 用SHELXS进行结构解析 紧跟一个负数的TREF根据已知代码生成唯一解。 (之前运行的SHELX的.Lst 文件中可找到)。 有时在低对称性的空间群中也可以得到结构。(P1 不是P-1)。 3 用SHELXD进行结构分析 SHELXD也是一个黑匣子,但有些不够自动化。 FIND n 产生n个随机原子。不对称结构中,会比预 期的少约25% 的原子。 PLOP 扩展循环过程中原子数,比预期的原子多, 用3-5次循环。 MIND 确定独立原子和等效原子间距(例如结合

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