青藏高原冻土区土壤垂直剖面中微生物的分布与多样性.PDF

微生物学通报 Sep. 20, 2016, 43(9): 1902−1917 Microbiology China /wswxtbcn tongbao@ DOI: 10.13344/j.microbiol.china.151074 研究报告 青藏高原冻土区土壤垂直剖面中微生物的分布与多样性 1,2 1* 1,2 1,2* 3 3 王艳发 魏士平 崔鸿鹏 苏新 祝有海 卢振权 1,2 1,2 3 3 胡非 李来鹏 张帅 刘晖 (1. () 100083) (2. () 100083) (3. 100029) 摘 要：【目的】冻土区储存着大量的有机碳，全球气候的变化导致冻土不断融解退化，土壤 微生物对冻土有机碳的分解作用在一定程度上将会加重全球温室效应。在研究中，为了解冻土 区土壤微生物的分布与多样性，对青藏高原冻土区垂直剖面中的微生物组成进行研究。【方法】 采用分子生物学方法，对剖面土壤样品中的古菌与细菌的 16S rRNA 基因和真菌的ITS 序列进 行 PCR 扩增，并分别构建其基因文库，通过序列的同源性比较进行系统发育学分析和多样性 指数分析。【结果】垂直剖面土壤中古菌序列分别属于泉古菌(Crenarchaeota) 和广古菌 (Euryarchaeota) 两个门，它们分别占克隆序列总数的 29.0%和 71.0% ；其中泉古菌门只包括 Group1.3b/MCG-A 这一种类型，在古菌序列中所占的比例为29.0% ，广古菌门包括4 种类型， 其中Methanomicrobiales 序列在古菌克隆文库中所占比例较高(52.0%)；分层位看，冻土活动层 古菌优势类群包括Group1.3b/MCG-A 、Methanomicrobiales 和Methanosaetaceae ，过渡层的优势 类群包括 Group1.3b/MCG-A 和 Methanomicrobiales 两类，而古菌在冻土层的优势类群只有 Methanomicrobiales 这一种类型。细菌序列分属于 10 个类群，其中放线菌(Actinobacteria) 、厚 壁菌(Firmicutes) 与变形菌(Proteobacteria) 为剖面主要的优势类群，分别占克隆序列总数的 28.9% 、16.9%和 12.1%；在冻土活动层，细菌的优势类群为Proteobacteria 和Firmicutes ，而在 冻土过渡层与冻土层，细菌优势类群仅包括 Actinobacteria 一种类型。所有真菌序列均属于子 囊菌门(Ascomycota)和担子菌门(Basidiomycota) ，分别占克隆序列总数的75.3%和24.7%；子囊 菌以Cladosporium sp.和Pseudeurotium bakeri 为主要的优势类群，担子菌以Dioszegia sp.为主 要的优势类群，所占比例分别为35.5% 、34.4%和22.6%；真菌在冻土活动层的优势类群只包括 Pseudeurotium bakeri 这一种类型，而在冻土过渡层与冻土层，真菌优势类群则包括Dioszegia sp. 和Cladosporium sp. 两类。【结论】该剖面在垂直剖面上古菌、细菌与真菌多样性较高，冻土活 Foundation item: Funds of Oil and Gas Survey, China Geological Survey (No. GZH20140