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分子生物学基因组的结构与功能
二、病毒基因组的特点 1.基因组大小相差很大: HBV:3.2kb 痘病毒:300 kb 2.核酸结构多样性: DNA 或RNA 单链或双链 合环状分子或线性分子 3.基因组有连续的,有不连续的 大多数连续 流感病毒:8条单链RNA 4.编码序列90%(基因组) 5. 多为单拷贝,即每个基因只出现一次 6..基因有连续的和间断的 (有内含子) 7.相关基因丛集: 功能上相关的基因排列在一起 8.有重叠基因 9.含有不规则结构基因 基因之间无间隔区. mRNA5'端无帽子结构. 结构基因本身无翻译起始序列 三、典型病毒基因组介绍 1. SV40病毒基因组 双链环状DNA:5243bp 早期转录区:一个基因(2个蛋白质 t,T) 调控区(?400bp):复制起始点,启动子,增强子 晚期转录区:先转录出一个多顺反子mRNA VP1 mRNA VP2 mRNA VP3 mRNA VP3比VP2N端少1/3 AUG 位于VP2和 VP3内 UAA 内含子1 内含子2 前体mRNA 剪接方式1:去除内含子1 剪接方式2:去除内含子2 T-mRNA t -mRNA T- 抗原 t-抗原 分布于核内:100 KD 分布于胞浆内:18 KD T - 抗原和t-抗原mRNA前体的不同剪接方式 UAA 2、逆转录病毒(retroviruses) (1)一般特征 病毒(+)股RNA为2个拷贝,基本结构为: 5'帽-R-U5-PB--DLS-?-gag-pol-env-(onc-)- C-PB+-U3-R-poly(A)n 病毒颗粒中有两条相同的正股RNA+两条来自宿主细胞的tRNA A:编码区:所有逆转录病毒均含有3个基本结构基因 gag: 病毒衣壳蛋白 pol: 肽链内切酶,一个逆转录酶,一个与前病毒整 合相关的酶 env: 包膜蛋白 B:非编码区: 与基因组复制和基因表达有关 A: R区: 两端的重复序列,与cDNA合成有关 B: 引物结合区(primer binding site, PB) C: U区: U3 含强启动子,起始转录RNA. U5 与转录终止和加polyA有关 D: DLS-?-C区: DLS:两条病毒(+)RNA链结合位点 ?: 包装信号:RNA装入病毒颗粒 C: 调控区. (2)前病毒基因组的转录和翻译 A:逆转录病毒基因组的复制和转录都需要经过DNA中间体才能完成. RNA病毒 DNA前病毒 RNA病毒 (cDNA) 末端形成新的重复序列(U3-R-U5) 称长末端重复序列(LTR) long terminal repeat B:翻译 多顺反子mRNA gag-------------------pol(无起始密码子) 90% 形成gag蛋白 10%形成gag- pol 蛋白 剪接后形成env mRNA 第二节 原核生物基因组 一、原核生物基因组结构的特点: 1、基因组为环状双链DNA分子 2、只有一个复制起始点. 3、具有操纵子结构 指数个功能上相关的基因串联在一起,连同上游的调控区和 下游的转录终止信号构成基因的表达单位. 4、一般无重叠基因. 5、基因是连续的,无内含子 6、编码区在基因组中的比例 真核基因组 病毒基因组 7、基因组中重复序列很少 8、具有编码同工酶的基因(isogene) 9、存在可移动DNA序列 10、分子中有多功能识别区域 复制、转录起始区 复制、转录终止区 二、质粒(plasmid) 是细菌内携带的染色体以外的DNA分子 是共价闭合环状DNA(covalent closed circular DNA, cccDNA) 1、最大特点: 可独立复制 2、质粒的遗传控制 /txsdxbk/170420/5299784.html /txsdxbk/170420/5299747.html /txsdxbk/170420/5299743.html /txsdxbk/170420/5299732.html /txsdxbk/170420/5299728.html /txsdxbk/170420/5299721.html /txsdxbk/170420/5299719.html /txsdxbk/170420/5299717.html /
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