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生物化学研究技术PPT3 SDSPAGE鉴定菠萝蛋白酶纯度
SDS鉴定菠萝蛋白酶的纯度;一、实验目的;二、实验原理;影响电泳的主要因素 ;聚丙烯酰胺凝胶电泳是以聚丙烯酰胺凝胶作为支持物的一种电泳。
这种凝胶是由丙烯酰胺单体(简称 Acr)和交联剂 N,Nˊ-甲叉双丙烯酰胺(简称Bis),在催化剂的作用下聚合而成的。;聚丙烯酰胺凝胶聚合的体系有两种,即化学聚合和光聚合。
化学聚合的引发剂是过硫酸铵[(NH4)2S2O3](简称Ap),催化剂是N,N,Nˊ,Nˊ-四甲基乙二胺(TEMED)。在催化剂TEMED的作用下,由过硫酸铵(Ap)形成氧的自由基,后者又使单体形成自由基,从而引起聚合作用。;聚丙烯酰胺凝胶的质量主要由凝胶浓度和交联度决定。
每100mL凝胶溶液中含有的单体(Acr)和交联剂(Bis)总克数称为凝胶浓度,用T%表示。
凝胶溶液中,交联剂(Bis)占单体(Acr)和交联剂(Bis)总量的百分数称为交联度,用C%表示。;不连续的聚丙烯酰胺凝胶电泳,带电颗粒在电场中的泳动有电荷效应、分子筛效应还具有浓缩效应。
(l) 浓缩效应
(2)电荷效应
(3)分子筛效应
;Gel;实验试剂配制 ;(5) 浓缩胶缓冲液(0.5mol/L Tris-HCl缓冲液,pH6.8): 取6g Tris溶解后,加1mol/L HCl溶液40ml,调pH至6.8,定容至100ml 。
(6) 10%SDS(十二烷基硫酸钠)溶液: 取5g SDS加水定容至50ml。(加热溶解)
(7) 2×电极缓冲液(0.1%SDS–0.05mol/L Tris–0.384mol/L甘氨酸缓冲液,pH8.3):取6gTris,28.8g甘氨酸和1g SDS加水溶解后,定容至1000ml(配好的溶液pH8.3)(12个组可配2升,使用时再稀释2倍)。 ;(8) 样品溶解液:取SDS 2g,β-巯基乙醇 5ml,甘油10ml,溴酚蓝0.1g,0.5mol/L pH6.8 Tris–HCl缓冲液 (浓缩胶缓冲液)10ml,加蒸馏水25ml,(最后的总体积为50 ml),装于棕色瓶。
(9)染色液(0.1%考马斯亮蓝-45%甲醇-10%冰乙酸溶液):1g考马斯亮蓝R250,加入450 ml 甲醇、100ml冰乙酸,用水定容至1000 ml。(12个组可配2000 ml)
(10)脱色液
高甲醇1000ml:甲醇 454ml,冰醋酸75ml,dH2O 471 ml
低甲醇1000ml :甲醇 50ml,冰醋酸75ml,dH2O 875 ml;七.实验步骤
1.清洗并吹干玻璃板。
2.在塑料胶条的两面涂少量凡士林(注意不能涂多,以防弄脏玻璃板)。
3.把玻璃板放入电泳槽中。
4.用小烧杯加6ml蒸馏水,2ml 30%凝胶储液,20 ul TEMED,100ul 10%过硫酸铵,混匀,迅速倒入封口槽处(一定要快!),静置约10min直到凝固。
聚丙烯酰胺具有神经毒性,操作时要戴手套
5.加dH2O于两层玻璃之间,检查玻璃底是否漏水;如果漏水,要重装。;6.按下表用小烧杯配12%分离胶,混匀,灌胶,高度离梳子约1~1.5cm,然后覆盖一层水,凝胶时间为15~30min,胶与水分层,倾倒去水。;
7.凝好胶,垂直拔掉梳子(不要左右摇梳子)。
8.上槽加入电泳缓冲液(电极缓冲液稀释2倍),液面需没过低玻璃板;下槽电泳缓冲液没过玻璃板封胶处1cm。
9.用1.5ml ep管取100μl粗酶样品与100μl样品溶解液混合均匀,与蛋白质分子量标准一起置于沸水浴5min)。;10.微量注射器按下表2点样,隔孔点样,注意不要交叉污染(每点一个样都要清洗微量注射器)。
表2 点样方式;11.上槽接负极,下槽接正极。
12.恒电流电泳:浓缩胶,10~12 mA,待溴酚蓝迁移到浓缩胶与分离胶的界面调整电流至20mA。
13.待溴酚蓝迁移到距分离胶底部0.5~1cm处,结束电泳。
14.染色(20~30min),回收染色液。
15.脱色:高甲醇60~80ml,25min;高甲醇40~60ml 20min;低甲醇80~100ml完全脱净;16.拍照并画电泳图谱,计算标准蛋白、待测样品的相对迁移率(蛋白相对迁移率=蛋白迁移距离/指示剂迁移距离)。
17.用低分子量标准蛋白质所作的标准曲线,求待测样品亚基的相对分子量。
18.以标准蛋白质电泳的相对迁移率为横坐标(X),标准蛋白质分子量的对数为纵坐标(Y),绘标准蛋白质的标准曲线,再根据样品相对迁移率在曲线上求出其蛋白质的分子量。;蛋白名称 ;低分子量标准蛋白质的组分:
1) 兔磷酸化酶B 分子量 97,400
2) 牛血清白蛋白 分子量66,200
3) 兔肌动蛋白 分子量43,000
4) 牛碳酸酐酶 分子量31,000
5) 牛蛋白酶
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