assI新城疫病毒.PDF

维普资讯 中国动物检疫 2008年第 25卷第 8期 一3O一 一 株 ClassI新城疫病毒 中国分离株分子特性的研究 刘华雷 ’，蒋小刚 2j张 维 ’，赵云玲 ’，郑东霞 lj孙承英 ’，陈 飞 ’，王志亮 ’ (1．中国动物卫生与流行病学中心，山东青岛 266032；2．江苏省常州市武进 区畜牧兽医站，江苏常州 213021) 摘 要：对从健康家鸭中分离到的一株ClassI新城疫病毒分离株Duck／China／08—004／2008进行了遗传进化特 性研究。利用 RT—PCR扩增了该分离株 F基因的主要功能区片段 。并进行了克隆与序列分析。序列测定结果已经登 录到GenBank，登录号为EU589149。该分离株F蛋白裂解位点的组成为 112E-Q—Q—E—R—L117，具有典型新城疫 弱毒株的分子特征。同源性分析表明其与国内普遍使用的弱毒疫苗株 LaSota和V4核苷酸的同源性较低 (分别为 55．4％和 57．7％)。通过构建F基因的遗传进化树 ，结果表 明该分离株在分类地位上属于ClassI，与我国目前普遍使用 的弱毒疫苗株LaSota(Cl~sII中的基因II型)和V4(ClassII中的基因I型)处在不同的进化分支。通过构建57株 ClassI新城疫病毒的遗传进化树。表明本分离株与近年来香港活禽市场分离株较为类似 ，同属于基因3型。 关键词：新城疫病毒；ClassI；进化分析 中图分类号：$852．65+》《．5 文献标识码：A 文章编号 ：1005-944X(2008)08—0030—04 Charaeterization ofa ClassINewcastlediseasevirusstrain isolated from waterfowlin China LIU Hualei，JIANG Xiaogang2,ZHANG Wei，ZHAO Yunling，ZHENG Dongxia，SUN Chengying，CHEN Fei， WANG Zhiliang f1．ChinaAnimalHealthandEpidemiologyCenter，Qingdao266032；2．WujinAnimalHusbandryandVeterinary Station，Changzhou213021) Abstract：A ClassINewcastle diseasevirusstrain，Duck／China／08—004／2008，isolated from heahhyduck inChina wascharacterized genotypically．rI1Ilemain functionalregion oftheF gene comprising433nucleotideswasamplified bv RT—PCR and sequenced．The isolate waspredicted to be lentogenic based on the sequenceoffusion protein cleavagesite(112E—Q—Q—E—R—L117)．SequencecomparisonwithhtelivevaccinestrainusedinChinarevealedhtat hteFgeneoftheisolatehadalowernucleotidehomologywithLaSota(55．2％)andV4(54．O％)．Forgenotyping，a phylogeneticrteebased on nucleotides47—435ofhteF genewasconsturcted．Phylogeneticanalysisofthe fusion gene identified two clusters，namely ClassIand Class II．Among ClassII，nine genot