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单晶结构解析讲义完美版
晶体结构解析
Shelxtl 使用流程
※ 解析原始文件有hklraw文件),包含衍射数据;p4p文件,包含晶胞参数
为一个晶体的数据建立projectXPREP中发生hkl文件的矩阵转换,则需要输出新文件名的hkl等文件,因此要建立新的project。
※ 首先运行XPREP
※ 然后运行XSXPREP设定的空间群,寻找结构初解
※ 在XshellXPREP中设定其他的空间群
Xshell 使用流程
※ 找出重原子或者确定性大的原子
※ 找出其余非氢原子
※ 精修原子坐标
※ 精修各项异性参数
※ 找到氢原子(理论加氢或差值傅里叶图加氢)
※ 反复精修,直到wR2等指标收敛。最后的R10.06(0.08) wR20.16(0.18)
※ 通过HTABHTAB和EQIV指令写进ins文件中
※ 将原子排序(sort)
※ 在步骤1、2完成后,在ins文件中加入以下三条命令
bond $H
conf
acta
cif和fcf文件,将cif文件拷贝到planton所在文件夹中检测错误,也可以通过如下在线检测网址:/services/cif/checkcif.html
Acta E 投稿准备流程
投稿前,请务必切实做好如下工作:
※ 按步骤1、2、3解析晶体并生成相应cif和fcf文件。
※ 准备结构式图(Chemical structural diagram)、分子椭球图(Molecular ellipsoid diagram)和晶胞堆积图(Packing diagram),最好是pdf格式。
按要求撰写文章的文字部分,填写cif中相应段落,注意格式要求!
_publ_section_title 题目
_publ_section_abstract 摘要
_publ_section_related_literature 相关文献
_publ_section_comment 评论
_publ_section_exptl_prep 制备方法
_publ_section_exptl_refinement 精修说明
_publ_section_references 参考文献
_publ_section_figure_captions 插图说明
_publ_section_table_legends 表格说明
_publ_section_acknowledgements 致谢
※ 将cif中需要填写的其他部分(在cif的标准空白样本中以!标注)全部完成,并再次检查整个cif文件格式和内容。
参考书目
单晶结构分析原理与实践 O723/0301
陈小明,蔡继文, 科学出版社 2003
2007年第2版 O723/10001
固体科学中的空间群 O711/8401
(美)(G.Burns),(A.M.Galzer) 高等教育出版社 1981
结晶化学导论 O711/8401
(英)(R.C.Evans), 人民教育出版社 1980
结晶化学导论 O74/10002
钱逸泰,中国科学技术大学出版社 2005
晶体结构的周期性和对称性 O723/9201
周公度, 高等教育出版社 1992
X射线分析的发展 O434.1/8901
(英)(Bragg,W.L.), 科学出版社 1988
X射线衍射分析原理与应用 O657.39/0401
刘粤惠,刘平安, 化学出版社 2003
晶体生长 O78/81001
张克从,张乐惠, 科学出版社 1981
超分子化学
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