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- 2017-08-11 发布于重庆
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分子生物学看图总结
1、细菌转化,所谓细菌转化,是指一种细菌菌株由于捕获了来自另一种细菌菌株的DNA而导致性状特征发生遗传改变的生命过程。提供转化DNA的菌株叫作供体菌株,接受转化DNA的细菌菌株则被称为受体菌株。将快速生长中的大肠杆菌置于经0℃)预处理的低渗氯化钙溶液中,使细胞膨胀形成原生质球,与外源DNA形成粘附在细胞表面的复合物。42℃下做短暂热刺激,复合物便会被细胞所吸收。在全培养基中生长一段时间使转化基因实现表达,就可涂布于选择性培养基中分离转化子。
2、整个PCR反应的全过程,即DNA解链(变性)、引物与模板相结合(退火)、DNA合成(链的延伸)三步,可以被不断重复。经多次循环之后,反应混合物中所含有的双链DNA分子数,即两条引物结合位点之间的DNA区段的拷贝数,理论上的最高值应是2n。主要步骤:将含有待扩增DNA样品的反应混合物放置在高温(94℃)环境下加热1分钟,使双链DNA变性,形成单链模板DNA然后降低反应温度(约50℃),致冷1分钟,使寡核苷酸引物与两条单链模板DNA发生退火作用并结合在靶DNA区段两端的互补序列位置上。最后,将反应混合物的温度上升到72左右保温1-数分钟,在DNA聚合酶的作用下,从引物的3-端加入脱氧核苷三磷酸,并沿着模板分子按5→3方向延伸,合成新生DNA互补链。
图5-16 聚合酶链式反应示意图。(a)起始材料,双链DNA;(b)反应混合物加热后发生链分离,降温使引物结合到待扩增靶DNA区段两端的退火位点上;(c)Taq聚合酶以单链DNA为模板在引物的引导下利用反应混合物中的dNTPs合成互补的新链DNA;(d)将反应混合物再次加热,使旧链和新链分开;(e)合成新的互补链DNA;(f)重复b;(g)重复c、、、、、、3、cDNA基因克隆
真核生物基因组庞大,含有大量重复序列。无论是电泳分离技术还是通过杂交的方法,都难以直接分离到目的基因片段。尽管高等生物一般具有3-5万种左右不同的基因,在单个细胞或组织的特定时间段中,仅有15-20%左右的基因得以表达cDNA克隆的基本过程是通过一系列酶催作用,使总poly(A)mRNA转变成双链cDNA群体并插入到适当的载体分子上,转化大肠杆菌寄主菌株细胞,构成包含所有基因编码序列的cDNA基因文库可应用Promega PolyAT tract mRNA 分离系统分离多聚(A)mRNA。将用生物素标记的寡聚(dT)引物与细胞总RNA共温育,加入与微磁球相连的抗生物素蛋白,用磁场吸附通过寡聚(dT)引物与抗生物素蛋白及强力微磁球相连的mRNA。
图5-26 PolyATtract mRNA的分离纯化过程简图。
图5-27 cDNA合成过程示意图
5、cDNA RACE(cDNA末端快速扩增)
是用于从已知cDNA片段扩增全长基因的方法,它根据已知序列设计基因片段内部特异引物,由该片段向外侧进行PCR扩增得到目的序列。用于扩增5’端的方法称为5’RACE,用于扩增3’端的称为3’RACE。5’RACE
1. 在反转录酶的作用下,以已知基因片段内部。特异性引物启始cDNA第一条链的合成2. RNase混合物降解模板mRNA,纯化cDNA第一条链。3. 用末端转移酶在cDNA链3‘端加入连续的dCTP4. 以连有oligo(dG) 的锚定引物和基因片段内部特异的nested引物进行PCR扩增,以期得到目的片段,并可用nest PCR进行检测。
6. 基因的图位克隆法(Map-based cloning)所有具有某种表现型的基因都可以通过该方法克隆得到。首先,通过构建遗传连锁图,将目的基因定位到某个染色体的特定位点,并在其两侧确定紧密连锁的RFLP或RAPD分子标记通过对许多不同的生态型及大量限制性内切酶和杂交探针的分析,找出与目的基因距离最近的RFLP标记,通过染色体步移技术将位于这两个标记之间的基因片段克隆并分离出来
核酸的凝胶电泳自从琼脂糖(agarose)和聚丙烯酰胺(polyacrylamide)凝胶被引入核酸研究以来,按分子量大小分离DNA的凝胶电泳技术,已经发展成为一种分析鉴定重组DNA分子及蛋白质与核酸相互作用的重要实验手段。基本原理
一种分子被放置到电场中,它就会以一定的速度移向适当的电极。我们把这种电泳分子在电场作用下的迁移速度,叫做电泳的迁移率,它与电场强度和电泳分子本身所携带的净电荷数成正比,与片段大小成反比。生理条件下,核酸分子中的磷酸基团呈离子化状态,所以,DNA和RNA又被称为多聚阴离子(polyanions),在电场中向正电极的方向迁移。
由于糖-磷酸骨架在结构上的重复性质,相同数量的双链DNA几乎具有等量的净电荷,因此它们能以同样的速度向正电极方向迁移。琼脂糖凝胶分辨DNA片段的范围为0.2~50kb之间。聚丙烯酰胺凝胶的分辨范围为1到1
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