生物信息学论文人类血小板衍生生长因子序列的检索分析.docVIP

人类血小板衍生生长因子序列的检索分析 胜美 (云南师范大学 生命科学学院 650500) 【摘要】：血小板衍生生长因子（Platelet derived growth factor，PDGF）是贮存于血小板α颗粒中的一种碱性蛋白质。(p latelet2derived growth fac2tor, PDGF)是骨生长因子的一种,因最初从血小板中分离获取而得名。PDGF能促进成骨细胞的增生,协同其他因子促进骨愈合【1】。其次血小板衍生生长因子是一族多肽生长因子，对骨折愈合和修复进程具有积极的效应。作为重要的有丝分裂原，血小板衍生生长因子能够促进成骨细胞早期的DNA合成，使成骨细胞从静止状态G0/G1期进入到有复制潜能的S期，使分泌细胞增多，同时还能增强单核细胞、成纤维细胞的游走性，使局部成纤维细胞增殖、分化，从而促进骨形成。血小板衍生生长因子A与参与骨形成的调节，在骨折修复过程中起着重要作用。【2】再者血小板衍生生长因子( PDGFs) 信号途径主要参与调节胚胎的发育分化、细胞的生长增殖，并与多种疾病( 尤其是各类肿瘤) 的发病相关。近年研究表明该信号途径还参与多种组织器官的纤维化过程。【3】血小板衍生生长因子同时也是一类多功能的细胞调控因子。国外最近的研究表明，血小板衍生生长因子BB对成骨细胞具有明显的骨诱导效应；而另有研究证实，血小板衍生生长因子BB具有明显促进破骨细胞骨吸收的作用。【4】甚至有研究表明，血小板衍生生长因子具有美容抗衰老的作用。血小板衍生生长因子的功能的确强大，其应用也十分广泛。　目前，血小板衍生生长因子的应用在美国等发达国家十分广泛另外，血小板衍生生长因子PDGF在重度烧伤、皮肤病患、骨骼与牙齿缺损与再生已经关节修复方面的应用也取得了巨大的进展。8大类44个与 Entreze 体系相连的数据库，它们分别是 “Nucleotide Sequences” databases (15) ，“Protein Sequences” databses (4) ，“Structures” databases (5) ，“Genes” databases (4) ，“Gene Expression” databases (4)， “Taxonomy” databases (2) ，“Genomes” databases (6) ，“Literature” databases (4)。 1.2.2确定研究即检索对象 研究对象为人类血小板衍生生长因子，从而得到关键词——Pdgf homo sapiens 。并根据NCBI数据库检索原则进行pdgf [Ti] AND “homo sapiens” [ti]检索。 1.3 结果分析 对检索到的结果进行相关分析，通过NCBI检索体系检索找到5条与之相似（相关）的序列信息。为了方便接下来分析相应的给它们编号如下： 条目①Homo sapiens cDNA FLJ77868 complete cds, highly similar to Homo sapiens PRLTS mRNA for PDGF receptor beta-like tumor suppressor. 条目② Homo sapiens transmembrane glycoprotein (c-fms) gene, exon 1, and platelet-derived growth factor receptor (PDGF) gene, 3UTR. 条目③Homo sapiens PDGF beta gene, intron 1 sequence . 条目④ Homo sapiens PDGF beta gene, 5UTR sequence同此5’UTR顺序,PDGFβgeneHomo sapiens PRLTS mRNA for PDGF receptor beta-like tumor suppressor, complete cds. 以下是对这五个条目的相应分析。 1.3.1基因座、碱基对、核酸类型、物种来源的分析 表1.检索所得相似序列分析 基因座（locus） 碱基对（bp） 核酸类型 物种来源 条目① AK289450 1767 线型mRNA 人类 条目② HUMCFMS01 874 线型mRNA 人类 条目③ HOSAPDGFB2 60 线型DNA 人类 条目④ HOSAPDGFB1 50 线型DNA 人类 条目⑤