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遗传多样性分析

吉林农业大学学报 2010,32(1):75~80 http://xuebao. M.edu.cn JournalofJilinAgriculturalUniversity E—mail:flndxb@rip.sina.corn 貂、貉源犬瘟热病毒流行毒株 H基 因的克隆及 遗传多样性分析 张 维,王君玮 ,李 林,赵永刚,任炜杰,王志亮 中国动物卫生与流行病学 中心,青岛266114 摘 要 :为研究鼬科动物犬瘟热病毒 (caninedistempervirus,CDV)毒株 的变异特性 ,对分离 自不 同地 区貉 、貂的 5个CDV毒株和 1个CDV国内弱毒疫苗株 (vacChina)的H基因进行 了核苷酸测序 ,并与 l2个参考毒株构建系 统发生树。结果表 明:5个流行毒株之 间H基 因核苷酸序列 同源性均达到97.5%以上 ,vacChina与5个流行毒 株 的H基 因核苷酸序列同源性普遍较低 (9o.5%~91.8%),而与 国外疫苗株 Convac和 Onderstepoort的H基 因 核苷酸 同源性达 96.8%和 97.2%。流行毒株之 间H蛋 白氨基酸 同源性差 别不大 (97.1%~100.0%),流行毒 株与vacChina疫苗株 H蛋 白氨基酸 同源性普遍较低 (89.7% ~91.8%),vacChina与 Onderstepoort、Convae有着很 高的同源性,其 H蛋 白氨基酸同源性分别为97.1%、95.6%。结果分析显示,CDV的流行和免疫失败现象 的发 生与 国内所用疫苗毒株和野毒株的遗传关系甚远有关。 关键词 :犬瘟热病毒 ;克隆;遗传分析 ;同源性比较 中图分类号:Q785;$858.92 文献标识码 :A 文章编号 :1000.5684(2010)01—0075—06 CloningandHereditaryVarietyAnalysisofH GeneofCanineDistemper VirusDetected inNaturally InfectedRaccoonDogs,FoxesandM inks ZHANGWei,WANGJun—wei,LILin,ZHAOYong—gang,RENWei—jie,WANGZhi—liang ChinaAnima lHealthEpizoologyCentre,Qingdao266114,China Abstract:Tocharacterizethevariabilityofrecentfieldisolatesof5caninedistempervirus(CDV)strains from differenthostsandgeographicalareas,weconductednucleotidesequenceanalysisoftheH geneen- codingthehaemagglutininprotein.Pronounceddifferencesbetween5fieldisolateswererevealedincon— parisontotheattenuatedvaccinestrainsvacChina,ConvacandOnderstepoort.Phylogenetictreewascon— structedwithH geneof5CDV isolates,vaccinestrainvacChinaand 12CDV strainsinGeneBank.Re— suhs:Thehomologyofnucleicacidsequencesamongihe5isolateswashigh (97.6%一99.9%).The homoloyg ofnucleicacidsequencesbetweenvacChinaand5isolateswaslow(90.5%一 91.8%)while highwithforeignvaccines,vacConvac(H:96.8%)andvacOnderstepoort(H:97.2%).Thedifferenceof aminoacidhomologyofHproteinamong5isolateswasnothigh(97.

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