分子生物学技术习题和答案.DOC

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分子生物学技术习题和答案

第5-6章 分子生物学研究方法 习题及答案 简述分子杂交的一般程序? 1) DNA和RNA的杂交 制备DNA或RNA样品→与固定基质结合→80℃真空固定→预杂交→加入标记探针杂交→洗涤→放射自显影或显色反应。 2)蛋白质的免疫分析 制备蛋白质样品→与固定基质结合→常温空气中固定→封闭剂封闭→ 一抗反应→洗涤→二抗-酶偶联物反应→洗涤→显色反应(EIA) 或 → 一抗放射标记物→洗涤→放射自显影(RIA) 简述Southern blotting基本方法? 将DNA标本用限制性内切酶消化后,经琼脂糖凝胶电泳分离各酶解片段; 经碱变性,Tris缓冲液中和,高盐下通过毛吸作用将DNA从凝胶中转印至硝酸纤维素滤膜上,烘干固定,凝胶中DNA片段的相对位置在DNA片段转移到滤膜的过程中继续保持着。 附着在滤膜上的DNA与32P标记的探针杂交,利用放射自显影术确定探针互补的每条DNA带的位置,确定在众多酶解产物中含某一特定序列的DNA片段的位置和大小。 分子杂交检测常用的探针类型有---------? 分子杂交检测其互补序列的标记DNA或RNA序列,能在许多DNA或RNA序列的复杂混合物中识别所需克隆的分子。 DNA探针(DNA probe) RNA探针(RNA probe) 简并探针(degenerate probe) 生物芯片的一般类型包括那些,举例说明?或填空? 1. 按照芯片基质上固定的生物材料的不同,可以将生物芯片划分为DNA或基因芯片、蛋白质芯片、RNA芯片、细胞芯片、组织芯片、芯片实验室(Lab on chip)。 如果芯片上固定的是肽或蛋白,则称为肽芯片或蛋白芯片; 如果芯片上固定的分子是寡核苷酸探针或DNA,就是DNA芯片。 根据生物化学反应过程,又可以将生物芯片进行另外一种分类:因为通常的生物化学反应过程包括三步:即样品的制备、生化反应、结果检测和分析。 所以我们可以根据这三个不同的步骤,把生物芯片分为不同的类型即用于样品制备的生物芯片,生化反应生物芯片及各种检测用生物芯片等。 按照芯片上基因探针的密度又可将基因芯片分为高、中、低密度三种。 按照芯片上固定的核酸大小可以分为三种类型、两种模式:寡核苷酸芯片、cDNA芯片和基因组芯片。 对于人类来说,SNP的意义在于哪些? 1、致病SNP 2、疾病易感性SNP 3、具有诊断价值的SNP 4、疾病的SNP谱 5、人表型相关SNP 6、药物作用与不良反应的SNP 7、药物剂量SNP 请解释什么是基因组DNA文库(genomic DNA library)? 利用限制性核酸内切酶将组织或细胞染色体DNA切割后,与适当载体连接后转入受体菌,这些受体菌包含了所有基因组DNA信息,总称基因组DNA文库 cDNA文库(cDNA library):以mRNA为模板,利用反转录酶合成与mRNA互补的DNA,再复制成双链cDNA片段,与适当载体连接后转入受体菌,这些受体菌包含了所有cDNA信息,总称cDNA文库 。常用于筛选编码蛋白质的结构基因。 请简述构建基因文库的基本程序? 1)提取研究对象基因组DNA,制备合适大小的DNA片段,或提取组织或器官的mRNA并反转录成cDNA; 2) DNA片段或cDNA片段与经特殊处理的载体连接形成重组DNA; 3)重组DNA转化宿主细胞或体外包装后侵染受体菌; 4)阳性重组菌落或噬菌斑的选择。 简答?一个理想的基因组DNA文库应具备下列条件? 重组克隆的总数不宜过大,以减轻筛选工作的压力 载体的装载量最好大于基因的长度,避免基因被分隔克隆 克隆与克隆之间必须存在足够长度的重叠区域,以利克隆排序 克隆片段易于从载体分子上完整卸载 重组克隆能稳定保存、扩增、筛选等后续操作 自身引导合成第二链的原理怎样? ?? 首先用氢氧化钠消化杂合双链中的mRNA 链,解离的第一链 cDNA 的 3‘-末端就会形成一个发夹环(发夹环的产生是第一链 cDNA 合成时的特性,原因至今未知,据推测可能是由帽子的特殊结构相关), 这个发夹结构可以作为引物并引导 DNA 聚合酶复制出第二链,此时形成的双链之间是连接在一起的,再利用 S1 核酸酶将连接处切开(仅该位点处为单链结构,切断形成平端结构,可以进行后续连接反应) 。 在PCR时,简述前三个周期中的重要变化? 第一周期中,合成的每一条新生链都超出了另一个引物的位置;在第二个周期中, 通过同样的变性、复性、延伸步骤,进行新一轮的扩增,以第一周期中合成的DNA 为模板合成的DNA位于两引物位置之间,这就是所需扩增的特异DNA片段;在第三个 周期中,经过同样的变性、复性、延伸步骤进行扩增, 在第三个周期中,经过同样的变性、复性、延伸步骤进行扩增,以第二轮中的新生链 为模板,就形成特异DNA双链,以后每增加一轮,它扩增一

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