膜蛋白结构解析技术新进展.PDFVIP

七 膜蛋白结构解析技术新进展 蛋白表达、溶解和结晶这一系列技术瓶颈的突破，使得研究膜蛋 白的原子结构成为可能。 细胞中有大约30 % 的蛋白质是膜蛋白，不过人们现在还不是很 清楚这些膜蛋白的原子结构。到目前为止，在PDB （Protein Data Bank ）中只有不到1% 的资料是膜蛋白的结构数据。这不是说膜蛋白 的结构不重要，相反，膜受体蛋白非常重要，它们是大部分药物的作 用靶点。但由于一直缺乏很好的膜蛋白大量可溶性表达技术，因此也 图片说明：最新得到的GPCR膜蛋白 结构图。 就得不到足够的蛋白结晶体用于结构分析。即使是结构基因组学 （文 图片来源： Nature 454, 183- 187; 2008 后小词典）这项旨在分析每一个蛋白家族结构的学科，也因为存在技 术难题而没有将研究重点放在膜蛋白上。 现在，经过传统结构生物学家和结构基因组学家的不懈努力，蛋白表达、溶解和结晶这一系列的技术瓶 颈都得到了突破，并且已经出现了部分成果。 2007年和2008年，学术界接连发表了好几篇具有里程碑意义的文章，这几篇文章都是有关G蛋白偶联受 体 （G protein–coupled receptor, GPCR）结晶体结构这一传统结构学难题方面的论文。 诸如美国纽约膜蛋白结构协会 （New York Consortium on Membrane Protein Structures, NYCOMPS ） 和膜蛋白结构中心 （Center for Structures of Membrane Proteins, CSMP）这样的结构基因组学研究组织和 其他的几家国际性研究组织正在携手共同努力制定一个高效的、规范化的技术流程来研究膜蛋白结构。到目 前为止，已经得到了几个膜蛋白的结构资料。与此同时，不需要使用蛋白结晶体来研究结构的固态核磁共振 （solid-state NMR）技术也得到了飞速发展，不过该技术在敏感度和分辨率方面还需要进行进一步的改进。 现在还不太可能得到一个 “通用的、万能的”技术流程来分析所有的蛋白质结构，因此还需要开发出其 它一些针对不同蛋白质结构分析的研究方法。我们相信，未来几年会出现更多的研究膜蛋白结构的方法，在 PDB中也会找到更多膜蛋白结构数据。 原文检索：Nature Mehtods Published online: 17 December 2008; doi: 10.1038/ Nmeth.f . 240 YORK/编译 小词典 小词典 结构基因组学 （structural genomics ） 结构基因组学是一门用结构生物学方法研究整个生物体、整个细胞或整个基因组中所有的蛋白质和相关 蛋白质复合物的三维结构的学科。它主要利用实验方式 （X射线晶体学、核磁共振谱学和电子显微学）来测 定蛋白质结构，同时结合同源建模 （homology modelling ）这一计算方式来推测蛋白质结构。 和传统结构生物学不同的是，利用结构基因组学所测定的蛋白质结构通常是功能未知的蛋白质。这促使 科学家创立了结构生物信息学，利用三维结构信息来预测蛋白质功能。结构基因组学重视快速、高通量的蛋 白质结构测定，而同步辐射装置是实现这一目标的重要实验装置之一。 1919 生生命命奥奥秘秘wwwwww..lliiffeeoommiiccss..ccoomm 结构基因组学是继人类基因组之后又一个国际性科学大热点，主要目的是试图在生物体的整体水平上 （如全基因组、全细胞或完整的生物体）测定出 （以实验为主、包括理论预测）全部蛋白质分子、蛋白质－ 蛋白质、蛋白质－核酸、蛋白质－多