基于高通量测序研究青藏高原茶卡盐湖微生物多样性.PDF

微生物学通报 Aug. 20, 2017, 44(8): 1834−1846 Microbiology China /wswxtbcn tongbao@ DOI: 10.13344/j.microbiol.china.160752 研究报告 基于高通量测序研究青藏高原茶卡盐湖微生物多样性 1 1 1 1 2 1* 张欣 刘静 沈国平 龙启福 韩睿 朱德锐 (1. 810016) (2. 810016) 摘 要：【目的】茶卡盐湖(Chaka Salt Lake ，CSL)是青藏高原有名的天然结晶盐湖，具有独特的 石盐盐湖矿床，盛产青盐。盐湖卤水环境中存在丰富的嗜盐菌资源和潜在的新种，细菌和古菌的 群落结构特征和物种多样性尚不明确。【方法】采用Illumina 高通量测序平台对茶卡盐湖水样和 底泥混合物中的细菌和古菌群落进行 16S rRNA 基因(V3−V5 区) 高通量测序，检测4 个样本的群 落结构差异和微生物多样性。【结果】获得细菌和古菌总有效序列分别为117 192 和110 571 条。 结果分析表明细菌和古菌的物种注释(Operational taxonomic unit ，OTU)数目分别为421 和317 ， 获得分类地位明确的细菌种类为 14 门28 纲170 属，古菌为5 门4 纲34 属。细菌的优势类群是 厚壁菌门(Firmicutes) ，所占比例为68.37% ，其次为变形菌门Proteobacteria (20.49%)；优势种属 依次为芽孢杆菌属 Bacillus (41.94%) 、海洋芽孢杆菌属 Oceanobacillus (8.03%) 、假单胞菌属 Pseudomonas (7.67%)、盐厌氧菌属Halanaerobium (7.42%)和乳球菌属Lactococcus (7.38%)；古菌 的优势类群以广古菌门(Euryarchaeota)盐杆菌纲(Halobacteria)为主，优势菌是Halonotius (17.21%) 和盐红菌属Halorubrum (16.23%)。【结论】揭示了茶卡盐湖中细菌和古菌的群落结构及物种多样 性，为嗜盐菌的开发及后续微生物资源的挖掘提供了理论依据。 关键词：茶卡盐湖，细菌，古菌，高通量测序，微生物多样性 Illumina-based sequencing analysis of microbial community composition in Chaka Salt Lake in Qinghai-Tibet Plateau ZHANG Xin1 LIU Jing1 SHEN Guo-Ping1 LONG Qi-Fu1 HAN Rui2 ZHU De-Rui1* (1. Center for Basic Medical Research, Qinghai University, Xining, Qinghai 810016, China) (2. Academy of Agriculture and Forestry, Qinghai University, Xining, Qinghai 810016, China) Abstract: [Objetive] Chaka Salt Lake is a famous natural and crystal salt lake on the Qinghai-Tibet Plateau, having unique halite deposits and