西兰花种子及幼苗转录组研究及芥子油苷代谢通路构建.pdfVIP

ClassifiedIndex： Confidential(yes／no)：no DissertationfortheMaster Degree of RNA-·SeqAnalysis MetabolisminSeeds andGlucosinolate and of Sprouts …、 一 oleracea var．italica) Gao Candidate：Jinjun Li Supervisor：Prof．Jing Degree ofScience Category：Master ofLifeSciences College：College Firstlevel discipline：Bioscience level Seconddiscipline：Botany HarbinChina June2014 目 录 目 录 ㈣Y㈣2㈣6㈣2㈣川—● ㈣2…0眦—● 中文摘要………………………………………………………………………………………………一I 英文摘要………………………………………………………………………………………………．．III 1引言…………………………………………………………………………………………………。1 1．1高通量测序技术………………………………………………………………………．2 1．1．1高通量测序对基因组及基因表达研究的影响……………………………………．．2 1．1．2高通量测序基本原理和不同测序平台比较………………………………………．．3 1。1．3高通量测序在转录组分析中的应用………………………………………………．6 1．1．4高通量测序实验设计准则…………………………………………………………．8 1．1．5展望……………………………………………………………………………………………………………8 1．2芥子油苷研究进展……………………………………………………………………一9 1．2．1芥子油苷简介………………………………………………………………………．9 1。2．2芥子油苷对病原菌的抗性作用……………………………………………………．9 1．2．3芥子油苷抗病机制研究进展及存在的问题………………………………………12 1．2．4芥子油苷抗癌作用………………………………………………………………．．13 1．3西兰花研究进展………………………………………………………………………14 1．3．1西兰花简介………………………………………………………………………．．14 1。3。2西兰花中芥子油苷研究情况………………………………………………………15 1．4目的意义和实验思路…………………………………………………………………17 2材料与方法…………………………………………………………………………………………19 2．1样本收集与总RNA提取……………………………………………………………．．19 2．2cDNA文库建立与测序………………………………………………………………．19 nOCO 2．3读段过滤与从头拼接(Deassembly)…………………………………………20 2．4基因注释与分析………………………………………………