第7章 微生物分类与命名.pptVIP

第7章 微生物的分类与命名;第一节 微生物在生物中的分类地位;全生命系统树(P318图12－3);第二节 细菌的分类;一、分类单元及其等级 界Kingdom 门Phylum——亚门 纲Class——亚纲 目Order——亚目 科Family——亚科 属Genus 种Species;常用的细菌分类术语; 型（form或type),常指亚种以下的细分，当同种或同亚种不同菌株之间的性状差异，不足以分为心的亚种时，可以细分为不同的型。 种（species),是生物分类中基本的分类单元和分类等级。;二. 微生物的命名;2. 命名模式及其指定 如前所述，由于细菌分类单元的划分缺乏一个易于操作的统一标准，为了减少因采用不同标准界定分类单元所造成的混乱， 细菌系统分类也像其他生物分类一样采用“模式概念”。即根据命名法规要求，正式命名的分类单元应指定一个命名模式（简称模式）作为该分类单元命名的依据。 ;3. 新名称的发表 根据细菌命名法规的规定，有效发表新的细菌名称应在公开发行的刊物上进行。 若新名称是在国际系统细菌学杂志（IJSB）以外的其他杂志上发表的，还必须经过新名称的合格化发表，被认为合格后，在该杂志上定期公布，命名日期即从公布之日算起，否则不算合格发表，也不能取得国际上的承认。 发表新名称时，应在新名称之后加上所属新分类等级的缩写词，如新目“ord.nov.”、新属“gen.nov.”、新种“sp.nov.”等。 ; 20世纪60年代以前，国际上不少细菌分类学家都曾对细菌进行过全面的分类，提出过一些在当代有影响的细菌分类系统。但70年代以后，对细菌进行全面分类的、影响最大的是《伯杰氏手册》。所以该书目前已成为对细菌进行分类鉴定的主要参考书。 ;四、 细菌分类鉴定的特征和技术;（一）形态学和生理生化特征;2．生理生化特征 （1）生理： 需氧性、温敏性、噬盐性、与宿主的关系、生活史（有性生殖情况）等 （2）生化： 营养类型（自养/异养）、对碳源的利用能力、对氮源的利用能力、对生长因子的需要、对抗生素及抑菌剂的敏感性、代谢产物（酶、毒素等）、对 pH 的适应性等 肠杆菌科细菌的分类主要靠生理生化;（二）血清学试验与噬菌体分型;2.噬菌体分型 在原核生物中已普遍发现有相应种类的噬菌体.噬菌体对宿主的感染和列解作用具有高度的特异性,即一种噬菌体往往只能感染或裂解某种细菌,甚至只裂解种内的某些菌株. 所以,根据噬菌体的宿主范围可将细菌分为不同的噬菌型和利用噬菌体裂解这样的特异性进行细菌鉴定. 这对于追溯传染病来源、流行病调查以及病原菌的检测鉴定有重要意义. ;（三）氨基酸的顺序和蛋白质的分析;（四）核酸的碱基组成和分子杂交;第三节 病毒的分类;一、病毒分类机构;二、病毒分类原理及其依据;二、病毒分类原理及其依据;病毒粒子特性;病毒抗原性质和生物学特性;三、病毒的分类系统;Avian influenza virus,AIV;;SARS; ;;;;四、病毒分类现状;二、病毒的分类系统 1995年，由Murphy等整理发表了第六次病毒学分类报告，将动物病毒分为三大类；第一类是DNA病毒；第二类为DNA和RNA反录病毒；第三类是RNA病毒。经过以后的几次修改和补充，2000年出版了第7次分类报告，在部分科之上建立了3个目，其中一个尾病毒目（Nidovirales），涉及噬菌体，另2个目涉及动物病毒，分别是单负股病毒目（Mononegavirales）和套式病毒目（Nidovirales）。另外将卫星病毒、类病毒和朊病毒归在亚病毒类。其中类病毒科的词尾为“viroidae”、属名词尾是“viroid”。有关病毒分类与命名的现状详见表3-1。;五、病毒的命名