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同源四倍体自然群体的连锁不平衡分析模型.pdf
第38卷第4期 南京林业大学学报(自然科学版) V01．38。No．4
2014年7月 of Sciences Jul．，2014
Journal Edition)
NanjingForestryUniversity(Natural
doi：10．3969／j．issn．1000—2006．2014．04．006
同源四倍体自然群体的连锁不平衡分析模型
冯思思1，王建新1’，庞晓明1，邬荣领h
(1．北京林业大学计算生物学中心，北京100083；2．北京林业大学信息学院，北京100083)
摘要：半数以上的被子植物是多倍体或在其进化史上出现过多倍体现象，连锁不平衡分析是研究自然群体遣传
结构、分化及多样性的重要工具，但这一方法目前仅适用于二倍体自然群体。笔者根据同源四倍体减数分裂的
特点推导出计算分子标记间连锁不平衡的统计模型，利用基因频率和基因型频率的关系，以计算机模拟试验验
证了模型的有效性，并给出了模型的适用条件，即样本数量为200时，采用该模型估算的平均值可以满足分析
要求。
关键词：同源四倍体：连锁不平衡；统计模型；最大期望算法
中图分类号：$722 文献标志码：A
Amodelfor inan natural
linkagedisequilibriumanalysisautotetraploidpopulation
FENG
Sisil，WANGJianxinl’-，PANG
Xiaomin91，WURonglin91‘
for ofInformation
(1．Center Forestry 100083，China；2．School
ComputationalBiology，BeijingUniversity，Beijing
Forestry 100083，China)
ScienceTechnology，BeijingUniversity，Beijing
in his-
than50％of have their
Abstract：More doublingevolutionary
angiospermsa弛polyploidy．orexperiencedgenome
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avaluableto the andevolutionof
tory．Thus，polyploids plants．Linkagedisequilibriumanaly·
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sishasbeen usedinferthe and of itsbasic
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