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景行资源管理调度WEB页面使用方式-高性能计算平台-西北
西北农林科技大学
高性能计算平台用户使用手册
北京景行锐创软件有限公司
时间:2015-11-18
联系人:刘炜、周兆永
电话目录
第一章高算平台介绍 4
第二章命令行使用方式 5
2.1. 编译的登陆方式 5
2.1.1 Windows用户访问方式: 5
2.1.2 Linux和mac的登陆方式: 6
2.2. 数据上传方式 6
2.3. 景行资源管理与调度软件简单介绍 6
2.4. 景行调度作业提交命令: 11
2.4.1 单节点单核、多核任务的提交方式: 11
2.4.2 单节点单核、多核并且程序需要的内存大于60G 任务的提交方式: 11
2.4.3 多节点多核任务的提交方式(mpirun): 11
2.4.4 ncl的提交方式 11
2.4.5 wrf作业提交方式 12
2.4.6 cfs作业提交方式 12
2.4.7 cesm作业提交方式 12
2.4.8 指定作业运行的内存限制(单节点多核任务) 12
2.4.9 小作业提交方式 12
2.5. 景行调度作业管理 12
2.5.1 提交作业 12
2.5.2 查看作业信息 13
2.5.3 作业控制 13
2.5.4 查看作业历史 13
2.5.5 修改作业信息 13
第三章基于WEB页面使用方式 13
3.1 jre安装介绍 13
3.2 vncviewer安装介绍 14
第四章高算平台使用 18
4.1. 登录 18
4.2. 编译节点使用 19
4.3. 提交任务 21
4.3.1 wrf应用提交 21
4.3.2 matlab应用提交 23
4.3.3 通用作业提交 25
4.3.4 blastx作业提交 26
4.3.5 并行通用作业提交 28
4.4. 作业管理使用 30
4.5. 分享组管理使用 39
4.6. 会话管理 40
4.7. 集群监控 41
4.8. 数据管理 49
3.9. 注销 57
第四章软件安装列表 57
第五章注意事项 57
5.1 支持的浏览器版本 57
5.2 jre的版本 57
5.3 上传下载打不开的原因 57
5.4 用户名登录失败的原因 57
5.5 管理员联系方式 58
高性能计算平台有106台计算节点、2台胖节点、1台GPU节点组成,外加1PB的数据存储。各个服务器的配置信息如下:
服务器 Cpu 内存 计算节点 2颗Intel Xeon E5-2680 V3总共24 核,2.5GHZ 64GB DDR4 2133 ECC内存 胖节点 4颗Intel Xeon E7-4850 V3供 56核,2.2GHZ 1024GB DDR4 2133 ECC内存 GPU节点 2颗Intel Xeon E5-2640 v3共16核,2.6GHZ 64GBDDR4 2133 ECC内存 第二章命令行使用方式
编译的登陆方式
Windows用户访问方式:
可以通过第三方工具(xshell、putty等)登陆高算平台,xshell的登陆方式如下图所示:
输入用户名密码直接登陆:
Linux和mac的登陆方式:
直接在terminal终端上输入:sshusername@06输入密码登陆。
数据上传方式
可以通过ftp和第三方工具winscp或者sftp的方式登陆。
景行资源管理与调度软件简单介绍
云计算资源管理:景行资源管理与调度软件可以将网络上的多个异构的计算机、集群资源整合为一个应用服务平台。应用程序不再局限于个人工作站的资源,也不需要为了使用应用服务平台的资源而改动程序,只需要一些简单的脚本和命令就能使应用程序使用到应用服务平台上的计算资源。并且景行资源管理与调度软件还可以根据主机的负载条件和应用程序的资源需求在整个应用服务平台中选择最合适的计算资源。景行资源管理与调度软件不仅可以管理物理计算资源,还可以通过与虚拟机管理系统集成管理主流的虚拟机计算资源(VMware、XEN和KVM等)。这些虚拟计算资源在启动时自动加入景行资源管理与调度软件应用服务平台,停止后自动退出平台。
执行作业:对于景行资源管理与调度软件管理的应用服务系统,远程执行作业的行为和在本机上执行作业是一样的。对于用户而言是透明的,即使是复杂的终端交互控制作业,也好像作业是在本地执行似的。当作业获得所需要的软硬件资源或应用服务系统负载较轻时,景行资源管理与调度软件会根据策略自动执行作业。在应用服务系统中,景行资源管理与调度软件对作业的可以进行完全控制,可以根据资源负载情况将作业挂起和恢复执行。景行资源管理与调度软件可以以交互式作业或批处理作业的形式执行串行的或并行的应用程序。当作业在一组负载较轻或空闲的资源上执行时,作业的执行效率会大大提高。
管理应用:对于景行资源管理与调度软件管理的应用服务系统,用户可以运行本地工作站上没
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