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dsRNA和RNA干扰技术
dsRNA和RNA干扰技术
综述 *** 审校 彭**
(中南大学湘雅医学院)
摘要:dsRNA在细胞内诱导同源序列的基因表达受抑的现象称为RNA干扰。其机理的日渐阐明使它有可能在基因敲除,基因功能测定等方面成为一项成熟的技术,这将在生命科学领域中引起深刻变化。本文就dsRNA和RNA干扰的关系,RNA干扰的机制和特点, RNA干扰技术的应用前景等作一综述。
关键词:dsRNA; RNA干扰 ; RNA干扰技术; 基因沉寂
外源和内源性双链RNA(double-stranded RNA dsRNA) 在细胞内诱导同源序列的基因表达受抑的现象称为RNA干扰。早在十年前,科学家们在向牵牛花转导色素合成基因时,观察到“共抑制”(cosupression),不仅是转入的基因为表达,而且自身的色素合成也减弱了。相似的现象还发生在真菌的研究中,当把合成类胡萝卜素的基因转入到红色面包霉中时,却导致了大约30%转染细胞自身基因的失活,这种现象称为“缓解”(quelling)。但是这种现象一直得不到令人信服的解释。1998年,在研究秀丽隐杆线虫基因沉默机制时发现,将反义RNA、正义RNA和双链RNA分别导入虫体内,作为对照组的正义核酸,虽不能与活性基因或mRNA结合,却同反义核酸有相似的阻断基因表达能力,与反义RNA传统机制相违背、而另人惊奇的是,双链RNA较正义RNA和反义RNA能更高效地阻断相应基因的表达,一直基因表达的效率比单链RNA至少高2个数量级。Fire等称这种现象为RNA干扰现象。RNA干扰现象已证实在一系列的生物中存在,包括植物[1]、真菌[2]、锥虫[3]、囊虫[4]、果蝇[5]和线虫 [6]。新近科学家在哺乳动物细胞中也观察到了这一现象[7]。生物界普遍存在的RNA干扰现象给现代生命科学所带来的冲击将是无法估量的,它将不仅能提供一种经济、快捷、高效的抑制基因表达的技术手段,而且有可能在基因功能测定,基因治疗等方面开辟一条新思路。
一、dsRNA的形成
由于dsRNA抑制基因表达具有潜在高效性,正常机体任何导致dsRNA形成的情况都会引起不需要的相应基因沉寂。所以正常机体内各种基因有效表达显然需要一套严密防止dsRNA形成的机制。这些机制包括:在进化水平上淘汰那些在两条DNA链上相应位置上都有启动子的基因,否则两条DNA链同时转录出两条互补的RNA就可能形成dsRNA;在正常生理条件下dsRNA的形成必须具有一定的条件如两条互补RNA链相遇,互相识别和一定浓度的RNA连接蛋白存在;在偶然情况下形成的dsRNA还必须具有抵御解链,共价修饰和降解双链RNA等酶作用的能力。此外,细胞对于外来的RNA和自身转录过程中生成的变异RNA(aberrant RNA)所产生的dsRNA引发RNA干扰能力大于拥有自身mRNA序列的dsRNA。与这些设想一致的实验在线虫和锥虫中得到证实[8]。
引发RNA干扰的dsRNA产生机制是通过对RNA干扰现象深入研究推断而来的。它包括内源性和外源性两个方面:RNA干扰作为一种防御外来核酸的免疫机制,外来核酸(包括DNA和RNA)的侵入就可能导致dsRNA的产生,如RNA病毒的入侵,DNA病毒在胞内的转录,基因工程中导入转基因,插入逆转的DNA片段等;内源性的dsRNA产生主要是通过RNA依赖的RNA合成酶(RDRP)的作用,它催化合成与机体转录过程中形成的异常RNA互补RNA链而形成dsRNA[9]。
二、dsRNA介导RNA干扰的机制
1998年Andrew Fire将dsRNA导入线虫内观察到RNA干扰现象后[6],科学家又在一系列的低等生物中观察到同样的现象,然而将dsRNA(长度>30bp)导入常用哺乳动物细胞培养株时却不能观察到特异的RNA干扰现象,而是出现诱生干扰素,活化核糖核酸酶L,细胞的基因表达全面受抑和细胞凋亡的现象[5,9]。这不禁使人疑问,哺乳动物中能不能被dsRNA诱导出RNA干扰。但是,实验证明,小鼠的卵母细胞和早期的胚胎中却存在这一现象[10]。随后,Zamore的研究小组发现诱发RNA干扰时dsRNA被切成21-25个碱基的RNA片段[11],同样,这些小片段的RNA也在果绳细胞外RNA干扰模型中出现[12]。科学家把这种小片段的RNA称为小干扰RNA(small interfering RNA siRNA),并且猜测RNA干扰正是由siRNA诱导。Elbashir SM工作组将体外合成的21nt的siRNA导入哺乳动物细胞培养株中也检测到了特异的RNA干扰现象[7]。
尽管RNA干扰的具体的机制和过程还不十分的清楚,研究资料显示RNA干扰过程可概括如下:第一步是dsRNA的处理;dsRNA经过一种核酸酶Ⅲ类似的RNA内切酶Dicer作用,把dsRNA链酶切成
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