Rotor-Gene链融解曲线法甲基化标记筛选技术的建立.pdfVIP

· 116· 塑 堂堂亟!垦堂 2 生!旦 箜43卷 第1期 Rotor-Gene链融解曲线法甲基化标记筛选技术的建立 莫耀南 ， △赵贵森 郑海燕 刘 良 杨渝珍 1)华中科技大学同济医学院法医学系武汉430030 2)河南科技大学法医学院 洛阳471003 △男，45岁，博士研究生，教授，硕士研究生导师，研究方向：法医学，E．mail：yangyuzhenl318@yahoo．com．cn 关键词 DNA甲基化；链融解曲线法；亚硫酸氢盐；雄激素受体 中圈分类号 Q78 摘要 目的：建立基于Rotor-Gene的链融解曲线法的甲基化标记筛选技术，分析各种影响因素，评估其实用 性。方法：克隆Hela细胞雄激素受体基因外显子一1的Bisulfite-PCR产物，挑出经测序证实的可以代表不同甲基化 程度的～组质粒，并以之为模板，在Rotor—Gene 3 000实时定量PCR仪进行扩增和链融解，分析融链温度、链融解曲 线与甲基化程度、甲基化模式的相关性及各种影响因素。结果：基于Rotor．Gene的链融解曲线法，不仅可以区分甲 基化与非甲基化，而且能够鉴别片段内细微的甲基化差异；主要的影响因素有升温幅度、缓冲液离子强度、产物浓 度等。结论：基于Rotor-Gene的链融解曲线法，可以集扩增和链融解于一体，是～种经济简便的甲基化分析技术 ， 可用于样品的甲基化筛选。 Methylation--specific melting curve analysis with Rotor—Gene MO Yaonan ， ，ZHAO Guisen ，ZHENG Haiyan ，LIU Liang¨ YANG Yuzhen ， J)Department of Forensic Medicine，rong~Medical College，Huazhong University of Science and Technolo— gY，Wuhan 430030 2)College of Forensic Medicine，Henan University of Science and Technology，Luoy— ang 471003 Key words DNA methylation；melting curve analysis；bisulfite；androgen receptor Abstract Aim：To develop a simple methylation scanning technique using methylation specific melting curve analysis (MS·MCA)with Rotor—Gene．Methods：Plasmid clones containing androgen receptor(AR)exon一1 bisulfite fragment which represented different methylation patterns were prepared．Melting curve of the PCR products amplified from these plasmids was analyzed with a Rotor—Gene 3 000 real time thermal cycler．Results：PCR products representing different methylation patterns could be distinguished clearly．Main factors that affected the melting curves included salt concentration，products concentration and temperature