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酶分子结构特征
复习提问:酶催化反应的特点?
新课引入:酶催化反应的特点是通过酶分子结构反映出来的,下面我们一起来探讨酶分子的结构。
§5-3 酶分子的结构特征
按酶的化学组成将酶分为
结合酶酶
结合酶
酶
单纯酶(简单蛋白质)
辅因子
酶蛋白——蛋白质部分
金属辅因子
有机辅因子
辅酶
辅基
非蛋白质部分
全酶 = 酶蛋白 + 辅因子
全酶 = 酶蛋白 + 辅因子
决定酶反应的专一性
对电子或化学基团起传递作用
只有全酶才有催化活性,若两者分开,则酶的活性消失。
一、酶蛋白的结构特征
1、酶蛋白质一般具有球状外貌
根据酶蛋白分子的结构特点将酶分为三类
= 1 \* GB3 ①单体酶——具有三级结构
a. 一条多肽链
b. 如催化水解反应胰蛋白酶、广泛应用的工业用酶制剂等。
= 2 \* GB3 ②寡聚酶——具有四级结构
a. 由二个甚至多个亚基组成
b. 亚基间通过疏水作用力、氢键、离子键和范德华力联系而成整体分子。如烯醇化酶(二聚体)、乳酸脱氢酶(四聚体)
= 3 \* GB3 ③多酶体系
a. 由几种酶嵌合形成的复合体
b. 有利于一系列反应的连续进行
c. 相对分子质量很大
2、酶的相对分子质量
单体酶——在30000~60000之间,且40000左右较为集中,约占11%。如羧肽酶A由307个氨基酸殘基组成,相对分子质量为34600。
寡聚酶——至少是单体加倍,多者数万、几十万乃至数百万,二聚体约占36%、四聚体约占33%。如乳酸脱氢酶亚基相对分子质量为35000,酶相对分子质量为150000。
3、氨基酸组成和排列顺序与酶催化活性的关系
酶功能相近——氨基酸组成相近——氨基酸排列顺序相近(存在大量同源序列,尤其催化活性部位)
序列之间的差异,一般是在远离活性部位的地方。
4、氨基酸的空间分布
酶的内核(活性中心)——疏水性氨基酸居多。
酶的表面——亲水性氨基酸占优势,赋予酶的水溶性特点。
5、酶分子的柔顺性——酶在水溶液中通常以多种构象存在
无水状态——相对刚性(一种“锁定”构象)
有水状态——由“刚”向“柔”转化。
水作为一种极性和高介电常数的物质,像润滑剂一样,加到无水的酶中以后,就使酶由“刚”向“柔”转化,酶在与其底物相遇时,才可能发生专一性结合,并催化底物转变成产物。
二、酶的辅因子
酶的辅因子是酶分子结构中的非蛋白质组分,大部分酶必须有辅因子才显示活性。
1、辅因子的组成:
①金属辅因子
如Zn、Ca、Cu、Fe、Co、Mo等。结合酶中的金属离子有多方面功能,它们可能是酶活性中心的组成成分;有的可能在稳定酶分子的构象上起作用;有的可能作为桥梁使酶与底物相连接。
②有机辅因子
(1)维生素或其衍生物
(2)核苷酸,如ATP、ADP等
(3)苯醌类,如辅酶Q、质体醌等
(4)血红素类(铁卟啉)等
2、辅因子的分类:
辅酶(coenzyme):与酶蛋白结合松散,以非共价键相连。可透析除去。
辅基(prosthetic group):与酶蛋白结合较紧,以共价键相连。如铁卟啉或含B族维生素的化合物,用透析等方法不能使它们与酶蛋白分开。
辅酶与辅基在催化反应中作为氢(H+和e-)或某些化学基团的载体,起传递氢或化学基团的作用。
与转移氢有关的辅酶或辅基:如辅酶Ⅰ(NAD)辅酶Ⅱ(NADP)、FAD(黄素腺嘌呤二核苷酸)FMN(黄素单核苷酸)等。
与转移除氢以外的基团有关的辅酶或辅基:如ADP、ATP、辅酶A (传递酰基)、FH4(四氢叶酸,一碳基团载体)等。
三、酶的活性部位
1、全酶与活性部位的关系
全酶辅因子
全酶
辅因子
酶蛋白
必需基团
(残基)
非贡献残基
活性部位
结构残基
接触残基
辅助残基
结合部位
催化部位
(1)必需基团(essential group):常将活性部位的功能基团统称为必需基团。例如丝氨酸(Ser)羟基,组氨酸(His)的咪唑基,半胱氨酸(Cys)的巯基,天冬氨酸(Asp)、谷氨酸(Glu)的侧链羧基等。而酶活性中心以外的功能基团(结构残基)则在形成并维持酶的空间构象上也是必需的,故称为活性中心以外的必需基团。
(2)活性部位:在反应过程中酶与底物接触结合时,只限于酶分子的少数基团或较小的部位。酶分子中直接与底物substrate)结合,并催化底物发生化学反应的部位,称为酶的活性中心(active site)。。对需要辅助因子的酶来说,辅助因子也是活性中心的组成部分。
2、活性部位的大小、功能
酶(enzyme)的活性部位是酶完成催化功能的核心部位。却只是酶分子的很小一部分。它包括催化部位、结合部位和辅助残基。
酶的活性部位的各个部分是一个行使催化功能的整体。
3、活性部位出现频率高的氨基酸残基
“7+3+1”规律
出现频率最高:丝氨酸(Ser)、组氨酸(Hi
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