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核磁工作站操作
用MestRe-C 软件处理一维氢谱
随着傅立叶核磁谱仪的普及和仪器使用的开放,很多单位的核磁谱仪的使用几乎达到饱和,因此有些单位为提高效率,规定谱仪只用于采样,不得处理数据和谱图;也有时因满足某种需要对谱图或数据进行特定的处理,因此掌握一些核磁数据的处理技巧就很有必要了。
我们推荐使用MestRe-C 软件处理核磁数据。该软件可从 HYPERLINK / 网站免费下载。它有很多功能,若熟悉和掌握它,可以满足化学工作者的大部分要求。现就我们使用MestRe-C(3.6.9 版)处理一维氢谱的步骤、方法和体会作一简单介绍。
本文对一维谱中较复杂的分析如多重偶合、多峰分离、多谱批处理和谱之间的算术处理等一些功能没有涉及。
运行MestRe-C(3.6.9 版)软件的计算机操作系统应选用winme 或以后版本,本作者使用的是win XP 系统。本文核磁数据用VARIAN-Mercure plus 300M 波谱仪采集。
一、导入和变换
运行MestRe-C 软件,在其界面上用鼠标左键点击工具栏左端的图标,面
上出现import file对话框(见图1),在其中选择所要处理某一个实验数据文件夹,打开文件夹,选中名为fid 的文件(其他仪器采集的数据选其二进制格式的文件)。在select file type 选项中选所用谱仪的生产厂家和类型。对varian 仪器选automatic 也可,其他仪器的文件可否用automatic 读鼠标对fid 信号在图中的大小和位置进行调整。然后,移动鼠标到工具拦用左键按下按钮,在其下拉菜单中选full FT,对fid 信号进行傅立叶变换,即得核磁共振吸收曲线谱图(见图3)。
?
二、谱图的一般处理
1 调相位
相位调整可采用自动调整方式,也可采取手动调整方式。若想得到好的谱图,调整相位是必须的。调整时不仅需要耐心还更需要经验和技巧。
(1)自动调整
移动鼠标到工具拦用左键点击按钮,在其下拉菜单中共有四种方式供选择,通常选APT 方法。
(2)手动调整
若觉得自动调整结果不理想,可手动调整。用鼠标左键点击按钮,画面上出现标移动标线到指定的位置(见图5)。
相位分为零级相位和一级相位。调零级相位时,标线的位置对相位无影响,每个峰的左边或右边随着零级相位调整一齐上升或下降。调一级相位时,标线的位置对相位有特殊的影响:若我们打算标线的左边某个峰用一级相位调整时,标线左边的其他峰的变化同零级,而标线右边的所有峰的变化则与标线左边的相反,即调一级相位时,使标线左边的峰其左边上升,则标线右边的峰其左边则下降。反之也一样。交替使用零级相位和一级相位及恰当的标线位置,经过摸索大都可以得到好的相位和得到对称性满意的谱图。复位,重新再来。
2 调基线调整基线的目的有二:改善谱的外观和提高调乱相位可用对话框中按钮reset
点击工具栏process 按钮,在下拉菜单中选smooth ,出现smooth/derivative 对话框,默认值为2,用鼠标左键点击OK 即可。此步并非必要,可省略。
4 定标
在工具栏中用鼠标左键按下
按钮,然后移动鼠标到要定标的峰位(此时鼠标指针为十字线)上,点击鼠标左键则出现reference 选择框(见图6)
,可根据实际情况选择标准值。若没有所要的集团和数值,可在reference 选择框中添加新集团的标准值。选定后(见图7),用鼠标左键点击OK,然后用鼠标按起工具栏中按钮,则完成定标。
图8
5 标峰
在工具栏中用鼠标左键按下按钮,在其下拉菜单中,选peak picking ,此时鼠标指针成双峰形状,将鼠标移到将要标的峰附近按下鼠标左键后拖动,图上出现矩形虚框,将峰括在虚框范围内,松开鼠标左键既可看到标好的峰位,然后用鼠标在按钮旁的下拉菜单中选 list peaks ,则在画面上显示peak picking list 清单(见图8),可用清单中的功能键删除不希望的峰值。也可将清单中的数据拷贝到其他文档中编辑,以供分析等需要。
6 积分
积分可采用自动方式,也可采取手动方式。两种方式都有一定的误差。工作中手动积分更常用一些,积分是核磁数据分析的重要内容,要注意掌握好。
(1)自动积分
用鼠标左键点击工具栏中tool 按钮,在其下拉菜单选integration 中的automatic 1D integration ,则自动积分,自动积分的修改方法可参照下面手动积分的说明。
(2)手动积分
在工具栏中用鼠标左键按下按钮旁的下拉菜单,用鼠标选其中integrate 。移动鼠标到要积分峰的左端根部(此时鼠标指针旁多一积分线指示),按下鼠标左键(此时鼠标又变成指针成十字线)向右拖鼠标到要积分峰的右端根部,松开鼠标左键,即完成此峰的积分。再移动鼠标对其他峰积分。待要积分的峰全部积好后,
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